如卵巢包块属于恶性的，手术治疗之后，同时需要化疗，辅助放疗。也是因人而异，还要看具体年龄，是否结婚生育，每个人的情况不同处理的方案也是有所不同的。口服药物来治疗也是可以的。
卵巢囊肿会导致CA125增高，CA125是一种常见于卵巢上皮癌的肿瘤标志物，这种病人在检查时会出现CA125高于正常值。但在某些特定的条件下，也会引起盆腔炎、子宫内膜异位症、卵巢囊肿等疾病，特别是50岁以下的女性，CA125增高并不一定就是卵巢癌。女性50岁以上的女性，CA125水平增高，需要密切关注。
卵巢囊肿的良恶性不主要看大小，很大的也可能是良性的，很小也可能是恶性。一般如果超声下显示肿物是囊实性或者实性，伴有肿瘤标志物的升高，恶性可能性就比较大。如果是纯囊性肿物，尤其是壁薄，透声好的肿物，恶性可能性很小了。
一般情况下，良性卵巢囊肿可能会导致CA125轻微升高，具体分析如下：
良性卵巢囊肿有可能会导致CA125出现轻度升高，一般是由于卵巢巧克力囊肿导致的。结合病史，如果有痛经的病史并且进行性加重，还可能会不孕不育，另外半个月再复查的时CA125值没有改变，基本上就可以考虑是卵巢巧克力囊肿。
对于卵巢巧克力囊肿患者，建议尽快手术治疗，术后为了预防复发还要用相应的药物，连续用药三个月经周期或半年的时间。
一般情况下，如果患者的卵巢囊肿为生理性囊肿，卵巢囊肿CA125通常不会高；如果是病理性的则可能会高，具体内容如下：
CA125是一种糖蛋白复合物，有助于诊断患者的疾病，而卵巢囊肿CA125是否会增高需要根据其类型进行判断，并不能笼统地一概而论。如果女性体内存在生理性的卵巢囊肿，如卵巢滤泡囊肿、卵巢黄体囊肿等，此时，CA125通常不会比较高。但是，如果患者患有子宫内膜异位症、结核性腹膜炎等病症，检查结果可能会提示CA125偏高。
CA125血清小于35U/ml为卵巢癌。上皮性的卵巢癌抗原检测出，可被单克隆抗体OC125结合的糖蛋白，是来源于胚胎发育期体腔上皮，而在正常的卵巢组织当中是不存在的。最常见也就是上皮性的卵巢肿瘤，也就是浆液性肿瘤患者的血清当中，其诊断的敏感性较高，但是特异性较差。
