巧克力囊肿良性和恶性只能通过病理确定，卵巢的良恶性肿瘤判断是比较复杂的，要结合B超，肿瘤标记物检查，血检查等判断，一般良性肿瘤边界是清楚的，质地是比较均匀的，恶性肿瘤可能会伴有腹水，边界不清楚，具体的要去医院咨询专业医生做相关检查判断的。
巧克力囊肿术后的饮食是可以吃大蒜的，大蒜里面含有了非常丰富的核黄素，硫胺素等营养成分，具有很好的消积食，加速代谢，杀菌消毒的作用，对于疾病的康复会有很大的帮助作用。但是不宜多吃大蒜，因为大蒜属于辛辣刺激性的食物，会对胃肠道产生刺激。
巧克力囊肿手术之后要注意的，首先是按照医生说的按时吃孕三烯酮，然后按照医生说的时间定期复查肝功能，生活上好好休息一个月，一个月内不能性生活，不能盆浴，不能游泳。还需要注意不要吃冷冻的食物，不要抽烟喝酒，饮食生活规律，多吃蔬菜水果，适当的吃鱼肉蛋，不要吃刺激的食品，少喝咖啡，浓茶饮料。
巧克力囊肿确诊良性还是恶性应该予以手术探查的，囊肿切除之后立刻在手术室里进行冷冻切片显微化验，以确定囊肿是属良性或恶性。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
卵巢巧克力囊肿病人，由于经期时囊肿内出血较多，囊腔内压力增高，囊壁可出现小的裂缝并有极少量血液渗漏，但裂缝很快被漏出物引起的腹膜局部炎症反应和组织纤维化所闭合，并导致卵巢与临近的子宫和肠壁粘连，往往也累及输卵管，所以输卵管管腔可能通畅，但管壁因扭曲而影响其蠕动。
不一定，良性或者恶性可从患者的症状和生长速度等方面进行判断良性的卵巢囊肿一般生长慢，不良反应少，恶性的囊肿会迅速的长大，有时可能会有流血，腹痛等症状存在。良性囊肿多发生在生育期妇女身上;而恶性囊肿一般发作于青春期前少女、青少年或绝经后妇女。早期即有转移病灶，并迅速出现消瘦等恶性病变表现。体征：良性者常为单侧，可活动，表面光滑，包膜完整，囊性，不伴腹水;而恶性者有时为双侧，不活动，与周围组织常有粘连，部分为实性，表面不光滑，可能穿破包膜，种植在腹腔或盆腔内，在子宫直肠陷凹处可触到固定的结节，常伴有血性腹水，如抽吸腹水检查可能查到癌细胞。禁忌：1、饮食宜清淡，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等。2、适宜食物：牛奶、菠菜、山药、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生、黑米等。3、禁忌食品：蟹、带鱼、青鱼、鹅肉、狗肉、辣椒、生葱、生蒜、桂圆、橘子、白酒等。4、避免高度紧张及精神刺激，保持乐观情绪及充足睡眠。
