肛瘘手术前，一般进行心电图检查、血常规检查、肝功能等项目。同时，提前做好准备，并进行肛门超声检查。平时要注意休息，恢复体力，抗病能力和耐力有利于食物的恢复，注意肛门部位的清洁卫生，用稀盐水清洗，臀部洗浴，经常更换内衣。
肛瘘发病初期流脓较多，色黄而稠，粪臭味重。久之，脓液逐渐减少，时有时无，稀淡如水，如果过于疲劳，则脓液增多，可有粪便流出。有时瘘管外口可暂时封闭，但不久病人又会出现发烧、局部肿痛，封闭的外口可再度穿破，待脓液流出后症状才逐渐消失。
肛瘘手术挂线会在术后一周左右的时间进行紧线，肛瘘手术挂线是利用橡皮筋的弹力逐渐切割这部分括约肌，让括约肌逐渐坏死，是一个缓慢的过程，不会突然切断括约肌而导致肛门失禁。经过一周左右的时间，橡皮筋底下有一部分括约肌已经坏死，橡皮筋底下所勒的括约肌就没有这么多了。
肛瘘一旦形成，恢复的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。是脓水污染内裤，剧烈活动后可促使脓液外溢，局部经常受到刺激，皮肤摩擦、瘙痒，非常痛苦，影响工作和学习，久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，出现贫血，发作也越加频繁，形成互为因果。
肛瘘当然需要治疗，而且治疗方法只有手术治疗，肛瘘有比较简单的低位单纯肛瘘和比较难的高位复杂肛瘘。低位单纯肛瘘往往做肛瘘切除术就可以治号，而高位复杂肛瘘则需要做肛瘘切开术或者肛瘘挂线术。
