在临床上，可以通过临床表现来确诊偏头疼和三叉神经痛。
偏头疼通常是有前兆的，主要症状是视力的减退，或有散射的闪烁的斑纹，这说明偏头疼的症状，在头疼的时候，可以看到额部和大量的一种波动性头疼，有些病人还会影响到另外一边的头疼。三叉神经痛通常是一边电灼样、针刺样、刀割样的疼痛，这种疼痛通常不会超出中间的位置，通常是一边头疼，一边不会出现头疼症状；也有一些人会出现两侧的头疼，这种头疼会在几分钟到一分钟之间。
头痛的原因有很多，主要分为原发性和继发性。原发性主要指偏头痛，紧张型头痛，丛集性头痛。这几种头痛主要和遗传因素，情绪紧张，劳累等有关。另一种头痛主要是继发于其它疾病出现的头痛，包括头外伤，颅内肿瘤，颅内感染，脑血管病，这些都可以引起颅内压增高，从而造成头痛。
睡觉起来后头疼，可能是没休息好导致的，睡眠一般要保证八个小时，才可以保证正常的精力，太少会引起疲乏无力，精神不振，头疼头晕，也可能是着凉引起的感冒发烧，可以测量一下体温，查血常规。
偏头痛不属于三叉神经疼痛，三叉神经疼痛属于三叉神经附近的血管病变或者畸形压迫神经组织引起的疼痛。偏头痛与生活压力、内分泌失调等因素有关。偏头痛与三叉神经痛并无明显关系，临床上要注意鉴别，不可混淆，因为治疗方法不同。偏头痛是由于血管收缩和舒张功能紊乱而引起的血管性头痛。临床表现为单侧或双侧搏动性头痛，疼痛持续5-3天左右，伴有恶心呕吐等症状。非甾体类消炎止痛药物是治疗的主要方法。
三叉神经痛的治疗方式主要是手术治疗。也就是微血管减压术，针对三叉神经痛的病因里面，90%都是因为血管压迫引起的，在显微镜下，在三叉神经的根部发现和找到压迫的血管，把它剥开、电离，从病因上去除掉病因。
