要进行全身抗炎治疗，建议口服头孢类抗生素，加甲硝唑类药物，可以控制炎症，局部消毒以后把脓肿切开引流。引出脓肿内的脓汁，这样可以明显缓解疼痛，还使得炎症得到进一步的控制。
有脓液形成是可以用针刺破脓肿的。牙龈脓肿大多数是慢性牙周炎引起的，配合服用消炎药物进行治疗，要积极治疗牙周炎等原发性疾病，注意口腔卫生，清淡饮食，多吃蔬菜和水果。
主要是由于智齿冠周炎而导致的，由于颌骨的退化和牙齿退化不成比例，往往导致第三磨牙萌出位置不足而出现阻生，阻生的牙齿刺激周围的牙周组织产生炎症，称为智齿冠周炎。口服奥硝唑头孢和洛索洛芬钠改善缓解症状。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
脓肿初期积极行镇痛、抗感染及支持治疗，脓肿形成后可行引流或脓肿切除手术。可用药物治疗，在脓肿初期脓液尚未形成前，可清除大块牙石，冲洗牙周袋，根据情况给予镇痛药、抗生素或支持疗法。也可用手术治疗。
