脑干出血后遗症多会表现为颅神经异常，眼球活动异常，眼球内收障碍、外展障碍，瞳孔可能也会出现异常，如果影响三叉神经脊束核，患者会出现改面部感觉异常，如果影响到面、舌神经核，可以出现面瘫，主要是中枢性面瘫，还有舌瘫伸舌偏向一侧。如果影响了双侧锥体束，患者会出现肢体无力、偏瘫。如果双侧受累就会出现四肢瘫。总之脑干的后遗症的临床表现，主要根据受损部位的不同而表现不同。
脑干是人的大脑当中最重要的一个器官，相当娇嫩，即使有轻微出血，病情也相当严重，容易危及生命，造成死亡，且死亡率极高。治疗方案的制定是基于病人的病期、病理类型、身体状况等来确定的，具体到每一个病人的治疗方案都是有所不同的，主管医生会根据病人的情况给出一个合理的建议。
脑干出血一旦发生后，需要立即就医，并入住神经外科重症监护室。如果脑干出血量比较小，可以予以保守治疗。保守治疗主要包括动态监测患者生命体征、积极控制血压、动态复查头部CT，同时使用脱水降颅压药物、护胃药物及预防下肢深静脉血栓的药物等。
通常来说，脑干出血昏迷处理，需要根据实际情况判断，具体分析如下：
如果是急性期脑干出血，必须在ICU接受救治，因为头颈水肿会引起呼吸不通气，必须要进行气管插管、气管切开等手术。其次要进行积极使用甘露醇、呋塞米进行降压治疗，同时口服甘油果糖。
需要注意的是，平时要保证充足的睡眠，避免过度劳累，同时保持饮食营养均衡，适当参加户外活动，有助于身体健康。
脑干出血5ml，如果在住院期间没有发生相关严重的并发症，比如再出血、肺部感染、下肢深静脉血栓等并发症，患者很有可能得到较好的康复，其存活时间可能达到5年，甚至10年以上。如果在住院期间发生再出血，或者严重的脑水肿及相关并发症，患者有可能会在3周之内发生死亡。
高血压脑干出血是高血压急危重状态之一，其致残和致死率极高，由于该处属生命中枢而无法进行手术和介入治疗，因此仅能保守治疗，并仅能对症处理，保持生命体征、呼吸支持、预防并发症等，尚无专门疗法，推荐就近三甲医院进行诊治。
患者可选择血管紧张素转换酶抑制剂进行治疗，对动脉粥样硬化有较好疗效，但需长期服用才能见效。也可使用血管扩张剂（，可以降低血压，改善微循环，减少血栓形成和栓塞风险。
