甲状腺囊肿属于良性疾病，当囊肿较小时，对人体的身体健康没有影响，一般不需要特殊治疗，定期进行甲状腺彩超，甲状腺功能检查等随访。如果囊肿持续增大，出现压迫症状，或者疑有癌变，应择期慎重考虑手术治疗，术后长期以甲状腺激素替代。
甲状腺囊肿微创消融术效果一般较好。
甲状腺囊肿微创消融可避免传统的手术创伤，穿刺针局部高温具有坏死病灶凝固性、彻底清除病灶的效果。手术小时短，疗效显著。甲状腺囊肿微创消融术的主要局限性是甲状腺恶性肿瘤患者只能采用微创消融术切除肿瘤病灶，不能清洁周围淋巴结。但是可能会发生并发症，如喉管神经损伤等，手术治疗结束后，出现声音嘶哑、喉上神经损伤，喝水可能出现呛咳。
甲状腺囊肿最有效的治疗方法是手术切除。如果选用穿刺可以将囊肿中的液体抽出，短期效果很明显，病人也没有什么痛苦，但是囊壁仍然保留，之后还有形成囊肿的可能，所以手术切除是目前对于治疗甲状腺囊肿最可靠有效的方法。
甲状腺囊肿是可以治好的。老年甲状腺囊肿患者早期无任何不适，多无意识发现颈前肿物，亦有甲状腺结节病史。多为单发结节，偶见多发性结节，直径多在2-5厘米之间。甲状腺囊肿块呈圆形，表面光滑边界清晰，多不痛或轻微疼痛，无触痛，可随吞咽上下移动。甲状腺囊肿囊内压不高时质软，可触及囊性感；例如，在囊肉液体多、压力高的情况下，也可以触摸强韧。
甲状腺囊肿多为良性。甲状腺癌合并囊肿少见，约1%~2%，癌性囊肿、囊液细胞学检查通常可见癌细胞。曾用手术治疗甲状腺囊肿，多切除囊肿。
手术操作造成的骨肿瘤疤痕，影响美观，有一定的并发症。目前多主张穿刺抽取和注射硬化剂治疗。这些固化剂能使囊壁发生无菌性坏死，阻止囊肿生成，使囊壁粘连，达到治疗纤维化、囊肿堵塞、囊肿的目的。该治疗对薄壁囊肿效果最好，有效率达94%。厚壁囊肿疗效差。厚壁囊肿实变肿块与周围组织无明显边界，囊肿内容物血性，反复抽吸后快速积聚，应警惕癌变可能，宜采用手术治疗。术中病理活检为恶性肿瘤，按甲状腺癌处理。
甲状腺囊肿是一种囊状的囊肿，囊腔呈圆形，直径2-5cm，平滑，不会感到疼痛，也不会感到疼痛，主要是因为吞咽上下运动，多发结节多是单发结节，甲状腺囊内压不高，质地较软，液体多。
状腺囊肿一般没有任何征兆，如果囊肿很大或者里面有出血，那么就会出现疼痛、吞咽困难、呼吸困难、声音嘶哑等症状，如果是甲状腺囊肿，前期是没有什么感觉的，一般是偶然发现的，如果时间长了，就会出现甲状腺功能减低、胃纳减少、乏力、水肿等。
