小三阳首先应检测肝功能，化验血中HBV-DNA含量及前C基因变异情况，并通过必要的肝活检来正确分析这种“小三阳”是否需要采取治疗措施。一般而言，如果肝功能正常，HBV-DNA阴性，不需要治疗，半年定期复查。如果肝功能异常，HBV-DNA阳性，则需要治疗。
乙肝有癌变的几率，但只要肝功能正常就不会癌变，乙肝小三阳指的是表面抗原阳性，e抗体阳性，核心抗体阳性，乙肝小三阳，如果病情得不到较好的控制，会逐渐的出现病情进展，肝炎，肝硬化，甚至发生癌变，形成肝癌。
小三阳复发几率不太高。很多国外临床数据显示，乙肝小三阳康复停药在1年内的复发率高达37.5%～70%，国内报告没有如此高，由于乙肝小三阳病患治疗时，身体状况、病情发展阶段、选择的抗病毒治疗药物、治疗方法不同，停药复发的几率是不同的。
乙肝小三阳变成肝癌的几率大约占40.79%，比乙肝大三阳的几率要高。如果肝功能反复异常，病毒量持续升高，肝功能反复异常达到半年时间，可以进行抗病毒治疗，乙肝的治疗很多讲究，需要进行系统的检查和诊治。
首先是因为乙肝小三阳病毒可能悄悄变异，变成目前无法认识和检测到的形态，使乙肝小三阳患肝在不知不觉中纤维化和硬化或者癌变。而此时，在常规检测手段的监测下，可能乙肝小三阳肝功能正常、病毒DNA数据变化也不明显。显然比乙肝大三阳的危害性更具有隐蔽性，更容易癌变。
