连花清瘟胶囊副作用是烧心。连花清瘟胶囊的主要成份是连翘、金银花、大黄、甘草、板蓝根等。部分患者服用后出现烧心，考虑是药物成分在分解消化吸收过程中，刺激胃酸及胆汁分泌增多引起。这个症状一般不明显，停用药物后可以自行缓解，症状明显时，可以服用专业药物促进下排，减轻症状。另外对于外感寒邪入侵导致的风寒感冒，会很明显的加重感冒症状。建议在医师指导下口服连花清瘟胶囊。注意平时有胃胀、怕凉、不思饮食的，不要吃连花清瘟胶囊。
连花清瘟胶囊可以治疗感冒咳嗽，对于普通感冒、流行性感冒、新冠感染引起的咳嗽等症状均适用，可缓解不适，建议遵医嘱根据自身情况正确合理用药。
感冒通常是病毒等病原体感染引起的，由于病原体侵入机体引起炎症反应，使得炎性分泌物产生增多，呼吸道黏膜充血、水肿，会出现鼻塞流涕等症状，并诱发咳嗽反射导致咳嗽，还可出现发热、头痛、乏力、四肢酸痛等症状。
连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒、抗菌消炎等作用，可抑制腺病毒、副流感病毒、流感病毒、新冠病毒等多种病原体复制，减轻炎症反应，减少炎症因子的分泌，从而缓解咳嗽等不适症状。并且该药还有调节机体免疫功能的作用，可加快病情恢复，缩短病程。
服药治疗期间，患者还需注意保持清淡饮食，多喝水，滋润咽喉部，帮助缓解咳嗽。还应保持充足休息，避免过度劳累、接触刺激性物质等，均有助于病症恢复。
连花清瘟胶囊可以治疗感冒，属于临床常用的感冒类中成药，对于普通感冒及流感均适用，可有效缓解发热或高热、鼻塞、咽痛等不适症状。
中医认为，感冒与流感多数是在体内蕴火的基础上外感邪气后引起，治疗以解表祛除外邪、清解内热为主。连花清瘟胶囊组方中选用了薄荷、麻黄微微发汗以发散外邪；贯众、板蓝根、银花、连翘、石膏等清肺泄热；大黄下排毒火，让体内蕴积的火热、毒素随大便下排而出，可以有效缓解感冒、流感引起的不适症状，缩短病程。 并且该药为纯中药制剂，安全性良好，服用后不嗜睡，不会影响日常的学习生活。
连花清瘟胶囊对甲流所引起的鼻塞流涕等症状，有较佳的疗效。
当甲型H1N1、H3N2等流感病毒侵犯鼻腔时，病毒所引起的炎症反应，会使鼻黏膜充血水肿、鼻腔内分泌物增多，继而造成鼻腔阻塞，引起鼻塞、流鼻涕的症状。
甲流患者可以服用抗流感的药物治疗，如连花清瘟胶囊。该药物能抑制流感病毒等多种病毒，同时抑制炎症反应，有利于减轻呼吸道黏膜充血水肿、炎性渗出，从而缓解鼻塞流涕等症状。
除了服用药物治疗，患者还可以用热毛巾敷鼻，或采取按摩法，用双指夹鼻按揉双侧迎香穴1～2分钟，以辅助缓解鼻塞的症状。
连花清瘟胶囊是可以退烧的。
患者之所以会发热，是因为机体在受到病毒或细菌侵犯之后，可作出免疫反应，致使体温调节中枢调高体温调定点引起发热。连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫的现代药理作用，对于普通感冒、流行性感冒引起的发热、高热症状缓解效果较好，同时也可帮助改善头痛、肌肉酸痛、乏力、咳嗽、咽痛等不适症状，缩短病程。
若是用药后症状持续不缓解，高热不退，建议及时就医。另外，患者在发热期间，需注意做好防寒保暖工作，同时要大量补充水分，每日饮水量以1.5-2升为宜，有利于促进代谢，帮助散热。
连花清瘟胶囊可以治疗甲流。连花清瘟可清瘟解毒、宣肺泄热，对流行性感冒发热或高热、头痛、咽干咽痛、肌肉酸痛等症有效。
连花清瘟已先后34次被列入国家卫健委、中医药管理局发布的甲型流感、乙型流感、禽流感、新冠肺炎等疾病相关诊疗方案的推荐用药。
研究证实：连花清瘟在降低甲流患者疾病严重程度方面具有显著效果，连花清瘟组可显著缩短甲流患者发热、咳嗽、肌肉酸痛、乏力、头痛等流感症状持续时间，该研究还获得2011年度国家科技进步二等奖。
