巧克力囊肿是可以进行治疗的。巧克力囊肿可以配合中药来进行内分泌的调理，达到活血化瘀的效果。平时要注意保持清淡饮食为主，忌食辛辣刺激性食物和过于油腻的食物，注意戒烟戒酒。也可以使用手术进行治疗。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种。这些异位的子宫内膜组织与正常子宫组织类似。巧克力囊肿变大，有时会引起痛经，有时会破裂引起剧痛。巧克力囊肿不会发展成癌，概率非常低。囊肿已经超过了5厘米，建议及时手术治疗。
巧克力囊肿一般术后不会复发的，配合生活方面注意就可以了。平时一定要注意休息，饮食要清淡，多喝水，多吃青菜和水果，不要吃生冷辛辣的食物，注意腹部的保暖，定期做好复查，有情况要及时去医院处理。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经，尤其是会出现性前时疼痛出血，最大的危害就是导致女性不孕。如果发现反复腹痛及囊肿增大，需要手术切除。可以医院妇科检查明确，在治疗期间不用有性生活，平时多注意局部卫生。
巧克力囊肿不动手术可能会不断的增大。囊肿属于良性病变，对身体没有很大的影响，可以不做治疗或用中药调理，一般也没有什么特效药，有必要时可以再做手术切除。平时要多休息。
巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。
