阿奇霉素、克拉霉素、罗红霉素等都是治疗支原体的首选药物。
服用药物期间应严密观察患者病情变化，如果第一次服药后没有任何好转，或者服药过程中出现了副作用，要尽快就医，避免耽误病情。在治疗期间患者要尽量放松心情，养成良好的生活习惯，每天保持适量运动，有利于身体恢复。
一般情况下，小儿支原体感染可以服药。
小儿支原体感染常伴有咳嗽、咳咳痰、气喘等症状，还容易侵袭支气管、肺部、上呼吸道，从而引起支气管炎、肺炎、上呼吸道感染。患者可以在医生的指导下服用红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等药物进行治疗，还可以遵医嘱服用止咳化痰药物进行治疗，有助于缓解不适症状。如果病情比较严重，需要在医生的指导下通过静脉用药达到治疗效果。如果有气喘发作，则可以遵医嘱服用氨溴特罗口服溶液达到平喘的效果。
衣原体感染可以通过外用药物治疗，如克拉霉素。
大环内酯类抗生素是治疗衣原体感染的常用药物，克拉霉素、阿奇霉素、强力霉素、交沙霉素等。如果口服药物治疗效果不理想，可以选择输液治疗。
妇科衣原体感染不仅需要口服药物治疗，还要注意局部清洁卫生，穿宽松的棉质软内衣。
如果出现了解脲支原体感染的情况，通常可以外用高锰酸钾溶液、红核妇洁洗液等药。
解脲支原体主要寄居于人体的泌尿生殖道，可通过性接触、间接接触等途径传播。如果感染了解脲支原体，通常可以遵医嘱外用高锰酸钾溶液、红核妇洁洗液等药，以改善局部不适症状。
若外用药物作用不明显，可遵医嘱使用红霉素、氧氟沙星等药。
生殖感染需对症使用外用药。
生殖系统一般会因细菌、真菌、病毒等致病源出现感染。需对症用药进行治疗，如果是细菌感染，一般可使用抗生素药物进行治疗，如莫匹罗星软膏。若为真菌感染，则考虑使用抗真菌药物，如联苯苄唑乳膏。如果存在病毒感染，一般需使用阿昔洛韦乳膏外用进行抗病毒治疗。
阿奇霉素治疗支原体肺炎的疗程一般是先连续静脉点滴五天，症状有明显改善的话可以休息两天之后改为口服阿奇霉素五天，无明显改善的话可以休息两天之后再点滴五天。
