可以选择手术治疗，将病变切除，在局部麻醉下就可以进行。选择梭形的切口或者沿病变长轴的切口，仔细分离皮下组织和囊肿的周围，尽量避免碰破囊肿，因为有一部分病人可能合并有液化，会导致局部的污染，尽量将病变的完整切除。
考虑这种症状应该是一种腘窝囊肿。如果是腘窝囊肿的话，这也是一种腱鞘囊肿，比较严重的情况，会影响到病患的膝关节活动，建议尽快到当地的三级甲等公立医院的骨科门诊，尽量考虑门诊手术治疗。如果情况不是特别严重，可以采用粘贴膏药的方法进行治疗。
描述的事情可以判断，如果是位于皮肤表面的普通囊肿，那考虑是属于皮脂腺囊肿，这可以采用外部等我一般治疗。如使用硫黄皂清洗，另外可以用痤疮膏涂抹患处，这些都有助于恢复正常。如果反复的出现囊肿且伴有感染引起疼痛和红肿的话，应及时的去医院进行检查，这是可以进行切除的，而如果处于皮肤里面的囊肿，囊肿比较小的话不影响健康，可以不用治疗，继续观察就可以了，如果囊肿比较大的话可以进行手术切除。
一般需要住院3天-5天可以出院，十天后可以拆线。术后早期住院观察治疗，避免继发性细菌感染，给机体带来不适反应现象。注意休息避免劳累，固定患部减少活动，加强营养增加抵抗力，及时给予消炎对症处理，按时复查处理及康复锻炼身体，早期恢复健康。
如果左侧腘窝囊肿较小可以采取保守治疗，卧床休息，制动，尽量避免着凉或者劳累，劳损等不利因素，局部可以外敷活血化瘀的膏药或者配合针刺，艾灸等物理疗法，以促进囊肿吸收，如果左侧腘窝囊肿较大，可以选择手术治疗，切开后将囊肿摘除。
