目前我国儿童肾小球肾炎发病率较低，治疗主要根据致病原因、疾病类型、病情严重程度。
目前治疗肾炎的药主要有：免疫抑制剂、抗感染药、利尿剂、降压药、降脂药、抗凝药、血小板聚集药、保肾排毒药等，医生根据患者的具体情况及化验指标变化调整药物种类和剂量。急性期患者要卧床休息，症状明显的患者卧床4-6周，血压平稳、水肿消退、肉眼血尿消失、尿常规及其他检查正常后可逐步活动。
肾小球肾炎的治疗需要确定病人是急性肾小球肾炎还是慢性肾小球肾炎。对于急性肾小球肾炎，通常治疗链球菌感染。大多数病人在三到四周内恢复。慢性肾小球肾炎通常需要肾活检。根据24小时尿蛋白定量，肾活检病理决定是否使用激素或激素联合免疫抑制疗法。
肾小球肾炎分为急性肾炎、慢性肾炎和急进性肾小球肾炎。急性肾炎多与上呼吸道感染密切相关，感染控制后，注意卧床休息、加强营养及维生素的摄入，可完全治疗。慢性肾小球肾炎无法治疗的，且缓慢进展，需长期服用药物进行治疗，延缓肾脏损害的发生。急进性肾小球肾炎多与免疫性疾病密切相关，需应用糖皮质激素及免疫抑制剂强化治疗，甚至需肾脏替代治疗，部分可治疗，部分转化为慢性肾小球肾炎。
肾小球肾炎若化验尿结果中，出现血尿、蛋白尿，可初步考虑肾小球肾炎。此外，需排除一系列其他现象，如出现血尿、蛋白尿，可因泌尿系感染引起。若排除检验误差或其他原因，且同时合并血压升高、水肿，如眼睑水肿、下肢水肿，可基本确诊为肾小球肾炎。
轻度系膜增生肾小球肾炎能治疗，系膜增生性肾炎的治疗要针对免疫发病机制的治疗，常包括糖皮质激素及免疫抑制剂治疗。血液净化治疗如血浆置换、免疫吸附等有效清除体内自身抗体和抗原抗体复合物。
