微波消融术的副作用包括轻度的疼痛、消融后综合征及无症状性胸腔积液等。消融后综合征常常表现为低热和全身不适，其持续时间与微波消融引起组织坏死的体积以及的全身状况有关，副作用都是自限性的，不需要治疗，基本在三天左右。
射频消融是一种快速的心律失常，比如室性早搏、房性心动过速、房性心动过速、室上性心动过速、房扑、房颤等。有冠状动脉粥样硬化的病人会有阵发性的室性心动过速，如果心动过速的发作部位、发作频率都比较典型，可以找出合适的射频治疗的部位靶点，综合评价患者的病情和手术的安全性。射频消融是一种一劳永逸的疗法，因为相比于药物，它可以彻底的控制病情，彻底的治愈。
房颤射频消融术后注意事项有日常护理、饮食等。
房颤射频消融术后必须重视术后护理工作，注意加强休息，忌过度劳累。还要保持正常的睡眠，防止发生心律失常和感染等并发症。可适当参加体育锻炼增强体质，选择合适的运动方式并逐步进行，加强体育锻炼等途径。还要注重心理上的调整，保持乐观积极的情绪。在饮食上加强调养，讲究全面均衡营养，但要注意控制盐的摄入，食盐日摄取量以5~6克为宜。还要注意合理搭配膳食。试着选些清淡的、易消化食物，应多吃含丰富维生素和纤维素相对较多的食品，还可适当补充含钙较多食品。另外，在手术前和手术后都应该注意身体的保养工作，特别是对伤口进行护理时更要注意细节问题。
消融术可以治疗心脏疾病，属于介入科的一种手术，将特殊的电极管通过血管插入心脏中需要治疗的地方，通过释放电流刺激心肌而阻滞心脏发生的异常心跳，使心脏恢复正常的功能作用。
消融术会残留、不彻底、易复发是其最大局限性，绝对不是某些民营医院宣传的那样会变成水，完全消失。如果选择消融，一定到大的正规医院，手术效果和术后随访都能得到保障。消融前多听听超声医生和甲状腺外科医生意见。
10年以上的绝大多数房颤病人都可以进行射频消融术，房颤的射频消融术是不需要开刀的，房颤射频消融术是一个介入治疗的方法，需要做动脉的穿刺以及心脏的导管下到心房肺静脉的周围，连接一些带有频率的仪器，通过放电的形式把心房或肺静脉周围产生异常电波的心肌组织给它消融掉。