肾炎的治疗很复杂，根据临床的诊断和病的类型来决定，如果是隐匿性肾小球肾炎，没有水肿，没有高血压，肾功能稳定，只有少量的血尿或者蛋白尿，无需特殊的药物治疗，只要避免劳累、感染以及肾损伤的药物，定期的监测血压，监测24小时的尿蛋白定量，内生肌酐清除率。
如果是隐匿性肾小球肾炎，没有水肿，没有高血压，肾功能稳定，只有少量的血尿或者蛋白尿，无需特殊的药物治疗，只要避免劳累、感染以及肾损伤的药物，定期的监测血压，监测24小时的尿蛋白定量，内生肌酐清除率。
秋石分为淡秋石和咸秋石，淡秋石的主要成分为尿酸钙与磷酸钙，而咸秋石的主要成为是氯化钠，秋石主要的功效从中医的角度主要是滋阴降火止血的作用，秋石的味道，偏咸没有毒性作用，但是秋石对肾炎患者并没有治疗的作用。
就目前而言，针对乙肝肾炎还没有特效的治疗方法，免疫制剂虽然对多种类型的肾小球肾炎有作用，但可能延缓宿主清除乙肝病毒的能力，因此多数人不主张激素治疗。
干扰素具有抗病毒的功效。对于肾脏的炎症，可以选择护肾的药物。其实乙肝的治疗很重要，如果能够将乙肝病毒控制在检测不到的程度，消除了病因，肾功能也会慢慢恢复，如果需要的话，可以选择免疫抑制剂或糖皮质激素来进行治疗。
在临床上肾炎有不同的病理类型，需要进行糖皮质激素及免疫抑制剂治疗，周期较少，综合价格都在上万元。如果使用足量糖皮质激素和环磷酰胺治疗两年左右的时间，不考虑复查的费用的话，治疗费用大概在5000到1万元。如果使用足量糖皮质激素和环孢素或者他克莫司、骁悉等药物治疗的话，不包括药物浓度检测和治疗效果复查的费用，在治疗两到三年的治疗费用约5-10万元，如果疗效不佳，治疗时间更长，那么费用会随之上浮。
