天性胆总管囊肿的发病原因，尚存争议，十年来随着对本病形态学、胆汁酶学及动物实验研究的进展，对其病因有了更深入的了解，多数学者认为本病与先天性胆胰管合流异常、胆总管远端梗阻有关。治疗小儿先天性胆总管囊肿主要是采取手术方法进行相对应的治疗，同时要注意的是术后期间要适当服用抗生素和其他的滋补食物来进行必要的营养补充。
通常情况下，先天性的小脑畸形可以通过手术来治疗。
小脑扁桃体下疝畸形是先天性的，只有手术才能治疗。没有明显的临床表现或只有轻度头痛的病人，通常不需要进行任何的治疗。如果出现了明显的共济失调，比如走路不稳，或者是由于压迫、粘连所致的脑干、颅内神经损伤，就需要进行外科手术。手术方式以头后窝和颈髓减压为主，多数病人在术后症状有明显好转。
一般情况下，心肌病有先天性的，具体内容如下：
心肌病是一个比较广泛的概念，其下囊括了扩张性心肌病、肥厚型心肌病、限制性心肌病等多种病症，而多数心肌病具有一定的遗传性。因此，除后天因素所致的病症外，心肌病也存在先天性的。其中，常染色体显性遗传可能会导致患者患有肥厚型心肌病，扩张性心肌病也可能与遗传性的致病基因相关。
肺炎是一种传染性疾病，没有遗传性。由于自身的免疫力较差，或是菌群失调造成。肺炎的治疗和处理要根据具体的原因来进行，如果是由细菌感染引起的肺炎，可以选择合适的抗感染药物进行抗感染，同时还要注意化痰等。如果是由真菌感染引起的肺炎，可以通过服用增强免疫力的药物来进行抗菌治疗。经过正规的治疗后，大多数患者都会出现咳嗽、咳痰等症状，有些患者还会出现发热等症状。
小儿疝气是先天性的，它是因为先天性的解剖结构鞘状突在出生以后没有闭塞，在腹股沟区遗留一个通道。
在腹压增加的诱发因素下，腹腔内、盆腔内的脏器比如说肠管、卵巢、子宫等通过这个通道由腹腔或者盆腔下降到腹股沟区或者阴囊内，形成一个质软的、可回纳的包块。小儿疝气往往不能自行愈合。保守治疗没有明显的效果，需要手术治疗。
女儿患有先天性腮瘘通常应及时进行治疗。
先天性腮瘘是由于胎儿在发育过程中咽喉部导管没有闭合。由于伤口裸露在外面，容易发炎、化脓，长期以往很可能导致恶变，只有手术才能解决问题。如果是腮瘘，需要做碘油造影，或者用造影剂注射造影剂，做X线或CT检查，看看鳃裂囊肿有没有内瘘。一般情况下，鳃裂囊肿是有瘘管的，有外瘘的，也有内瘘的。在做手术之前，必须先确定有没有外瘘或者内瘘。术中应沿囊肿包膜切除囊肿，同时切除瘘管，封闭瘘口。
