在治疗上关键在于早期诊断，早期控制感染，防止死骨形成，避免转为慢性骨髓炎。早期需要联合应用大剂量有效抗生素，通常在体温恢复正常后，仍继续使用两周左右。抗生素治疗2-3天，不能控制局部症状时，应即刻手术治疗。局部制动固定，缓解疼痛。慢性化脓性骨髓炎以手术治疗为主，原则上是清除死骨，炎性肉芽组织和消灭死腔。
骨髓炎的治疗方法有药物治疗和手术治疗。药物治疗如左氧氟沙星等。手术治疗又可分为穿刺吸引术、开窗引流术、带蒂肌肉瓣充填术以及截肢术。如果是骨髓炎的急性发作，可以使用一些抗生素来治疗，局部关节疼痛时可以使用止痛消炎的药物。骨髓炎的病人如果有严重的脓肿，可以住院进行局部切开引流，主要是钻孔引流术和开窗减压，术后还要进行患肢功能锻炼，在康复初期要注意控制运动强度，以免发生骨折。
血液中的微生物感染会导致骨髓炎。骨髓炎可能局限于骨髓，骨皮质，骨膜和周边组织。骨和关节的化脓性感染是由骨骼的解剖学生理因素、疾病、免疫系统的异常所致。如解剖学上的原因，骨营养动脉在长骨干骺端通常是毛细血管，血液流动缓慢，血液中的细菌会停止流动，如果是糖尿病、酒精中毒、血液系统恶性疾病、以及正在服用细胞毒性药物等，会引起中性粒细胞功能异常，从而引起全身抵抗力下降，从而引起骨髓炎。
目前应该最多的就是手术外加抗生素治疗，认为用抗生素消炎再结合手术清除就可以将牙齿跟骨髓炎治愈。日常吃食物的食物要注意不能吃过硬的食物，还有辛辣的食物以免发炎。还有就是需要打些点滴消炎要保持术后不发炎。
治疗骨髓炎的方法有以下几种：
骨髓炎在临床上是一种非常严重的骨性疾病，主要是由于化脓性细菌感染骨髓而引起的一种炎症性疾病。首先应该彻底的清除病灶，对病灶可以进行穿刺吸引，给予足量的抗菌素。在严重者可以在骨髓腔内进行钻孔，行开窗引流术，引出分泌物，防止炎症扩散。如果较严重的出现死骨现象就得行手术将死骨取出。如果已经出现多数窦道，或者已经发生恶变者，则需要截肢手术治疗。
