松果体区的小型囊肿通常没有任何征兆，通常无需手术，但是需要经常进行检查。如果肿瘤体积增大，会对导管造成压力，导致阻塞性脑膜炎，可以行脑室-腹膜分流手术，以减轻其水肿。
此外，也可以在手术中应用松果体区囊肿-脑室造瘘术，对松果体区囊肿合并脑膜腔内窥镜下切除，既能减轻颅内水肿，也能消除病因，减少术后的并发症，效果良好。
松果体囊肿在囊肿非常小的时候是没有什么症状表现的，没有什么感觉。而如果囊肿出现持续增大，会导致出现中脑导水管堵塞，这样可以引起脑积水，也就是出现梗阻性脑积水，从而引起颅内压增高的症状，可以表现为头疼以及呕吐和视物模糊。
松果体囊肿要根据囊肿大小来选择治疗方案。小的囊肿可以暂时观察，对于身体健康影响不大，但是平时要注意密切观察病情，要进行定期的复查，只要不出现持续的增长，也没有引起脑积水的话，就不用管它。而如果囊肿持续增大，或者现在已经比较大了，导致出现梗阻引起脑积水，就要进行手术处理，这个可以通过脑室镜进行微创手术处理。
松果体囊肿引起的症状大多源自于囊肿体积较大，对松果体及其周边重要脑结构产生了压迫，临床上较常见的症状有颅内压增高症状，比如头痛，呕吐。眼部症状，比如视物模糊，眼球运动障碍。压迫导水管造成梗阻性脑积水，昼夜节律障碍，癫痫，耳鸣等。松果体囊肿压迫腺垂体会使性腺激素分泌减少，引起不孕。
松果体囊肿常见，松果体囊肿属于一类良性的病变。在国内，国外的事件存在率高达百分之四十，即一少半的人都会发生松果体囊肿。多数体积比较小，只有在核磁共振检查时或体检时突然就发觉。
