手术方法取决于病因的性质，例如先天性肾盂输尿管连接部狭窄可作肾盂成型术，肾、输尿管结石可行碎石或取石术，这些手术近年可用内腔镜进行。术后肾积水及肾功能会有所改善。
因为右肾积水说明右侧的输尿管下端不太通畅，常见的原因就是输尿管结石引起的。所以，可以使用排石的药物治疗看看。如果肾积水消失了，就不严重的时注意休息，不吃辛辣刺激的食物，不要过度疲劳，可以用中药进行调理一下。
肾积水绝大多数都可以治疗好，特别是积水程度不重。如果积水程度很重，即使手术后肾脏积水只会部分缓解，不可能彻底恢复到与生病前一样的状况。肾积水治疗的主要目的避免肾功能损害，找到引起积水的原因，将引起积水的原因去掉，肾积水就会自然而然的缓解。
输尿管阻塞是造成肾脏积水常见的疾病，原因就是输尿管的一小段发生狭窄而引起阻塞，导致肾脏中的尿液不易流至膀胱，停滞在肾脏。小儿肾积水建议留院，让主治医生对引起肾积水病因进行处理，明确小儿肾积水的原因并对病因进行治疗。
肾积水的临床主要症状有结石疼痛、肿瘤血尿、尿道狭窄、排尿困难等。水的侧面在腰部膨大。复杂的感染包括寒战、发烧和脓尿。腰部囊性肿块在患侧。双侧慢性肾功能不全梗阻，尿毒症。腰痛腰囊性肿块。肾体积增大，皮质变薄，实质液暗区。X光静脉尿路造影显示肾积水。
