由于发炎的肛门被认为有炎症刺激，抗生素可以适当地用于治疗。患有痔疮的人也可以在使用药物治疗的同时，每天晚上用消炎的药水或者专门治疗痔疮的药水溶液坐浴来缓解症状。病人不应吃辛辣食物、饮酒、感冒、注意肛周卫生，排便后应及时清理肛门。
口腔临床上最常用的抗生素分别是硝基咪唑类抗生素和头孢菌素类抗生素。硝基咪唑类抗生素只针对厌氧菌感染。包括甲硝唑、替硝唑和奥硝唑，分别是一代、二代和三代药物。三代和二代药物比前一代的药物不良反应要更小，疗效更好。此类药物对胃有刺激，最好饭后服用。头孢菌素类抗生素是目前广泛使用的一种抗生素。
可以上午口服一次下午口服一次。通常间隔六到八小时就可以。要多休息，合理饮食，近期不要吃辛辣刺激性的食物，放松心情，保证充足睡眠，同时注意多漱口保持口腔的卫生。多喝水，禁烟禁酒。
口服消炎药物不能饮酒，酒的主要成分是乙醇，在体内转化成乙醛，消炎药物会抑制乙醛脱氢酶的作用，使酒精不能转化成水和二氧化碳排出体外，大部分抗感染的药物与酒精同服容易发生双硫仑反应，尤其是青霉素类、头孢类药物。
直肠的清洗，采用温皂水灌肠的方法，首先准备一个一次性的灌肠袋，温皂水约500毫升，水温大约40度左右。戴手套将一次性灌肠袋固定，距肛门大约40到60cm，开袋润滑油将灌肠袋的润滑头由上至下润滑。
