子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
手术与药物联合治疗：手术治疗前给予3-6个月的药物治疗，使异位病灶缩小、软化，有利于缩小手术范围和手术操作。对保守性手术、手术不彻底或术后疼痛不缓解者，术后给予药物治疗，推迟复发。保留卵巢功能手术：切除盆腔内病灶及子宫，保留至少一侧或部分卵巢。适用于III、IV期患者、症状明显且无生育要求的45岁以下患者。
月经期坚决杜绝性生活，避免剧烈运动；预防医源性情况导致子宫内膜异位症发生，如减少人工流产、刮宫，输卵管通液应选择月经结束的3-7天；适龄婚育，年龄较大且伴有痛经的孕妇，应尽早怀孕生子。已有子女暂时无需怀孕者，应采取药物避孕措施，既可避免怀孕，又可减少子宫内膜异位症发生。
西药治疗：通常包括促性腺激素释放激素激动剂，可令异位子宫内膜组织萎缩，从而达到治疗目的。手术治疗：切除内膜异位病灶，有的甚至切除子宫、卵巢；适用于药物无效的重症者。放射治疗：通过X光等破坏卵巢组织来消除卵巢激素的影响，使异位的内膜萎缩，达到治疗的目的。
子宫内膜异位症的治疗分两种方式，一种是药物，一种是手术，药物治疗只要是能够不来月经的，或者说月经量变少的药都对子宫内膜异位症有一定的治疗效果，宫内膜异位症很难彻底的治疗干净。
