部分输尿管结石患者可发生剧烈的疼痛，应立即送往医院的急诊科就诊。在医生处方下，运用解痉类药物，强效镇痛药物缓解疼痛。如果是胀痛或钝痛，可到泌尿外科检查，在排除肾脏积水的情况下，疼痛也尚能忍受时，通过多饮水，多做弹跳等适当运动，利于结石排出。
输尿管结石因导致尿液排出受阻，肾盂内压力突发增高，导致肾绞痛的发生。疼痛较剧烈，常常伴有恶心呕吐，及停止排气腹胀不适。需要与胆绞痛、阑尾炎、胰腺炎及卵巢囊肿蒂扭转等鉴别。肾绞痛可以通过肛门外用抗炎止痛药等。如果仍频繁出现肾绞痛，也可以通过行体外冲击波碎石，或留置输尿管支架解除梗阻，达到止痛效果。
输尿管结石痛可以多喝点水，产生大量的尿液，也可以扩张输尿管，这个时候会推送结石，通过输尿管排到膀胱里，这样就能缓解疼痛，另外是医院进行就诊，在医院里面，可以用解痉止痛的药物，使输尿管扩张，解除他输尿管的痉挛，从而达到止痛的目的。
必须使用一定的止疼药物。在输尿管活动的过程当中，有可能损伤输尿管的粘膜，刺激周围的神经，从而导致疼痛，这种疼痛称为肾绞痛。疼痛一旦发生，想要缓解，如果石头不动，自然而然疼痛就会慢慢减轻。
输尿管结石因为嵌顿位置不同，导致的疼痛部位也不同，如果在输尿管上段，可能是腰部疼痛，如果在输尿管下段，一般是靠近下腹，但是当排尿的过程中，如果膀胱结石进入尿道，造成尿道堵塞，会引起阴茎疼痛明显。
输尿管结石的治疗方法，根据泌尿CT平扫了解结石有没有积水、量大不大，如果通过一个部位肾积水，结石可以体外冲击波碎石，而太肥胖的病人好不推送，因为病人太肥胖了，脂肪把冲击波吸收了，这些病人用内窥镜做，而内窥镜又分经尿道、输尿管用硬镜做，也可以用软镜做。
