肌腱囊肿可保守治疗，也可以手术进行治疗。
肌腱囊肿又称为腱鞘囊肿，指肌腱腱鞘或关节处的韧带发生劳损性炎症，引起局部组织膜下积液，积液量渐多，可形成囊肿。腱鞘炎主要是因为长期的紧张劳累以及不良生活方式等因素造成。腱鞘囊肿可局部压揉，有时可将积液捏碎吸收囊壁粘连即可。如囊肿较大，不只影响美观，也会带来痛苦，就必须考虑手术切除。
腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。
宫颈囊肿一般可以通过手术进行治疗。
宫颈囊肿是一种生理上的改变，当鳞状上皮代替柱状上皮时，会有新的鳞状上皮覆盖住子宫颈腺管，堵塞腺管，造成腺体分泌物的排泄。
子宫颈囊肿的发生是由于子宫颈局部的损伤，或是由于长期的炎症，引起的腺管口狭窄。浅表的宫颈囊肿是在宫颈表面突出的，如果是深层的宫颈囊肿，那么在宫颈表面上看不出任何的异常，就会出现宫颈的肥大。子宫颈囊肿一般是不需要治疗的。
初期小的霰粒肿、囊肿不用医治，囊肿周围或囊肿内注射药物，可以帮助吸收。通常都采用手术治疗方式进行切除，手术过后做全身检查，检查有没有其他并发症的发生。如果没有其他并发症，就用中医针灸推拿方式，来进行疗养恢复。
一般数量不多的小的纳氏囊肿不需要特殊治疗，主要积极的治疗原发疾病，可以定期复诊。在合并有感染的时进行抗炎治疗。数量较多的或者体积较大的纳氏囊肿，可以通过激光、微波等物理治疗方法。
