脑血栓的治疗主要分为内科治疗、外科治疗和后期的康复治疗三种。内科治疗是在脑血栓的急性期，可以使用溶栓或者降纤的治疗，并且进行脑保护治疗，防止因为脑血栓而导致的并发症的出现。
脑血栓形成，是由于脑血管堵塞以后，引起的临床症状。患者会表现为偏瘫、失语，甚至意识障碍、感觉迟钝等。脑血栓形成的治疗，就是在发病的超早期，也就是4.5小时以内，积极进行溶栓治疗，包括动脉溶栓和静脉溶栓。如果错过了最佳溶栓时机，需要积极进行脑保护治疗。
脑外伤引起的癫痫可以采取药物治疗和手术治疗。
脑外伤引起的癫痫，属于继发性癫痫，一般情况下应该选择单药控制，当病情不能有效控制的时候，可以选用联合用药，通过口服丙戊酸钠缓释片和左乙拉西坦进行治疗。当患者出现癫痫发作时，可以注射地西泮，也可以考虑采取手术治疗或高压氧治疗，需要患者结合检查结果，明确诊断后再治疗。
脑梗死起病后，应及早就医，愈早来院愈佳。
如果错过最佳救治时机就会危及患者生命，可溶栓治疗，以三个小时内为宜，接下来的4-5小时内，至迟不超过六个小时。如果错过这个时间就会影响疗效。目前临床上对于急性脑梗塞主要采用药物溶栓进行治疗。有条件者，医院及家属亦可选择血管内介入对脑梗死进行治疗，但适应证的选择要严格。对于急性缺血性脑卒中患者进行及时有效的干预是非常重要的，这将对减少致残率、提高生活质量起到积极作用。脑梗死治疗一般以抗血小板聚集，降血脂等为主。还要对脑血管病危险因素进行处理，对血压，血糖，血脂等进行控制。对于脑血栓形成患者需要进行抗凝药物治疗，并且使用肝素类药物。其他疗法有康复训练、康复治疗等。
糖尿病引起的脑血栓可以通过药物进行治疗。长期慢性高血糖可造成毛细血管基底膜增厚，使管腔狭窄，加上糖尿病病人脂代谢紊乱，造成血液黏稠度升高，血流缓慢，可致脑血流量减少，导致脑毛细血管狭窄或比塞而引起脑血栓。
