输精管囊肿会影响射精功能及阻塞输精管，会导致不孕，但是输精管或射精管囊肿手术有一定的危险及后遗症，尤其对生育有一定的影响，但是如果不手术囊肿肿大还是会对生育有影响，术后注意定期复查一年，如果可以保守治疗，就吃一点药，同时温水坐浴促进血液循环。
睾丸囊肿有可能会堵塞输精管，输精管堵塞多由泌尿生殖系统的感染，如附睾炎、前列腺炎、精囊炎或附睾输精管结核等，造成输精管道梗阻，以附睾与输精管连接部较多见，睾丸和隐睾手术等误扎或损伤致输精管管腔梗阻。输精管造影也可诱发或加重输精管梗阻。
输精管囊肿较为难治，所以一定要到正规医院进行医治，它影响了男性的生殖系统健康，不要忽视它的重要性，输精管堵塞能对正常的生殖系统功能产生危害，也危及其生育能力。不要让它剥夺你做爸爸的权利。输精管重要，但是又是很脆弱。
可以考虑手术治疗。手术方法以显微镜下切除囊肿壁，严密缝合囊肿，以蛛网膜下腔的通道为主要治疗策略。对无症状者以及MRI显示囊肿和临床症状不明显者，一般不需要处理，可先行观察。
输精管是在体外触及不到的地方，即使发炎肿大的情况下，也是需要去医学检查的，如果想要确诊的情况下，就去正规的医院检查进行治疗。如果不是很严重的情况下的，是可以自愈的。如果严重的情况下，就要听从医生的，医生让怎么做就怎么做，这样效果才是好的。
