可能是甲状腺疾病：如自身免疫性甲状腺疾病、萎缩性甲状腺炎、产后甲状腺炎等导致的。也可能是非甲状腺疾病：如弥漫性结缔组织病也可见抗甲状腺过氧化物酶抗体增高。也考虑是生理性增高：正常老年女性可能会有抗甲状腺过氧化物酶抗体轻度增高的现象。
甲状腺抗过氧化物酶抗体升高，提示以下几点。
第一，自身免疫性甲状腺疾病，如桥本甲状腺炎、毒性弥漫性甲状腺肿，也就是Graves病。
第二，其他自身免疫性疾病也可表现为甲状腺抗过氧化物酶抗体升高，如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮。
甲状腺抗过氧化物酶抗体主要是甲状腺细胞受损后，细胞内甲状腺过氧化物酶进入血液，刺激机体产生自身免疫性甲状腺炎的标记抗体，与甲状腺球蛋白抗体的临床意义相同，但甲状腺过氧化物酶抗体的敏感性和特异性高于甲状腺球蛋白抗体。
抗甲状腺过氧化物酶抗体高，在多种自身免疫性甲状腺疾病中，都会出现升高，但是其升高的程度是不一样的。如果升高比较明显，要首先考虑自身免疫性甲状腺炎，比如桥本甲状腺炎。如果是轻度或者中度程度的升高，则考虑甲亢等疾病。所以甲状腺过氧化物酶抗体的水平，可以与其他甲功指标综合评估甲状腺疾病的病因。
甲状腺过氧化物酶抗体低，往往是正常的生理现象，不是疾病。
甲状腺过氧化物酶是甲状腺微粒体的主要抗原成分，其功能与甲状腺激素的合成有关。抗甲状腺过氧化物酶抗体的存在可能损伤甲状腺细胞。因此，正常人体内可以或存在较少的该抗体。抗甲状腺过氧化物酶抗体低，伴血清免疫球蛋白减少，经常感冒，可能与自身免疫力低下有关。建议患者养成生活习惯，避免熬夜，适当进行慢跑、跳绳、游泳等运动，增强体质，提高机体免疫力，改善状况，有助于防病。
怀孕之后若测定甲状腺功能的结果为抗甲状腺过氧化物酶抗体高，说明存在甲状腺的自身免疫因素。说明体内存在有抗甲状腺过氧化物酶抗体。单纯的甲状腺过氧化物酶抗体升高，并不严重。
甲状腺过氧化物酶抗体升高，多见于自身免疫性甲状腺疾病。特别是桥本氏甲状腺炎和弥漫性甲状腺肿，伴随甲状腺功能的抗体均有上升的可能，桥本氏甲状腺炎多上升。这是因为机体将甲状腺变为抗原，产生甲状腺自身抗体，往往有抗甲状腺球蛋白抗体、抗微粒体抗体、促甲状腺激素受体抗体。
桥本氏甲状腺炎的过氧化物酶抗体、球蛋白抗体、微粒体抗体涨幅非常高，弥漫性甲状腺肿轻度升高。在系统性红斑狼疮、多发性肌炎等自身免疫性疾病中，即使是这些自身免疫性疾病，由于机体对自身组织的认识不明确，也有可能产生抗体而发生疾病。发生抗体上升时，确定是什么疾病导致的抗体上升，并进行对症治疗。
