肝内胆管结石不能自愈，需要系统进行医学治疗，多继发于胆道系统感染或者有胆道蛔虫的病史，以及外伤之后导致的胆管损伤，或者先天性发育异常，有解剖胆管变异，容易导致胆汁淤积，继发形成结石。
胆管结石是肝胆外科中的常见疾病，不一定需要手术治疗。如果结石较小，没有明显的腹痛或腹痛发作次数较少，可以使用一些抗炎和清热解毒药物进行治疗。如果结石相对较大，通常会导致右上腹绞痛、寒战、高烧、黄疸等。进行外科治疗。
在日常生活当中也应该远离高胆固醇的食品和高脂肪食物。因为这些食物也容易诱发肝内胆管或者胆总管结石的形成。并且也应该以清淡容易消化的食物为主，多吃粗纤维食物也有利于肠道蠕动。同时也应该定期进行复查，远离烟酒环境，不能暴饮暴食，适当进行体育功能锻炼，平时也应该多喝水。
肝脏内的胆管结石，可以先尝试药物治疗。如果是胆总管结石，那么还是需要手术治疗，或者是取石。注意个人的饮食习惯，避免油腻高脂肪的食物，暴饮暴食，三餐尽量的规律。
如果胆囊穿孔，是一种非常严重的疾病。由于胆汁在胆囊中，是一种化学物质，如果胆囊破裂，会引起胆汁性腹膜炎、继发性细菌感染、败血症等严重并发症。因此一旦明确需要考虑及时的外科治疗，访问肝胆外科，不能延误治疗时间。
肝胆管结石引起胰腺炎可以通过保守治疗、手术治疗等方式进行治疗。
通常肝胆管结石引起胰腺炎患者需要禁食，根据病情决定胃肠减压，静脉补液，抗炎，抑酸抑酶等对症治疗。如果患者疼痛剧烈，可以遵医嘱使用塞来昔布、双氯芬酸钠片等药物缓解症状。必要时治疗需要及时进行手术治疗，期间患者应该规律作息，避免熬夜，以温软的流质饮食为主。
