长期服用的后果会直接影响肝、肾、脑等功能。而且氯氮平片的副作用是，镇静作用强和抗胆碱能不良反应较多，常见有头晕、无力、嗜睡、多汗、流涎、恶心、呕吐、口干、便秘、体位性低血压、心动过速。
长期服用氯氮平副作用会有头昏、乏力、嗜睡、多汗、流涎、恶心、呕吐、口干、便秘还有体位性低血压、心动过速的现象出现。氯氮平来治疗精神分裂症，对于精神分裂症的阳性症状和阴性症状都非常有效。
氯氮平想要成功停药，需要在患者巩固治疗期间病情稳定、自知力大部分恢复、社会功能受损不明显等情况下进行。氯氮平一般用于反复发作或者对其他抗精神病药物反应差的患者，停药需谨慎。
氯氮平是镇静高效的安眠药，是以抑制大脑来实现控制作用的，服用中自然会引起记忆下降，注意力不集中，反应迟钝等在某些方面可以影响认知，所以有时看起来就显得傻了。
长期服用可能会引起心悸，还会导致口干，有些人服药期间会表现出头晕和嗜睡的症状，甚至会导致血压减低。长期服用期间，也会影响到正常的食欲，病人还会经常便秘，有些人长期服用，可能体重会增加，也会经常腹痛。
氯氮平的相对严重的副作用是白细胞下降，属于较危险的副作用，需要定期检查血常规，观察白细胞是否有异常。若白细胞数量轻微下降，可服用增加白细胞类的药物，若白细胞下降较明显，需到血液科进行治愈。