如果囊肿比较小的，是可以治好的，自己逐渐的消失的。这种囊肿大部分情况下还是由于膝关节内的大量的关节积液，通过一定的通道跑到关节后面而形成的。长时间的站立行走以及剧烈运动会，导致膝关节的骨性关节炎加重，炎性渗出，同时还会出现滑膜炎症，导致关节腔积液增多，液体就会形成腘窝囊肿。
一般需要住院3天-5天可以出院，十天后可以拆线。术后早期住院观察治疗，避免继发性细菌感染，给机体带来不适反应现象。注意休息避免劳累，固定患部减少活动，加强营养增加抵抗力，及时给予消炎对症处理，按时复查处理及康复锻炼身体，早期恢复健康。
腘窝囊肿通常都需要在手术切开治疗。在手术直视下将腘窝囊肿完全分离，完整的将整个囊壁切除下来。术中可以根据腘窝囊肿大小，决定是否先切开囊肿，将囊液放出，再做出进一步的囊壁剥离。
对于病人出现腘窝囊肿的情况，如果是发生于生长发育期的青少年，多是由于先天性发育导致的，特别是有先天性腘窝内部的腱性滑膜发育异常，就会引起滑膜内部异常的液体分泌增多，导致腘窝囊肿的出现。
如果左侧腘窝囊肿较小可以采取保守治疗，卧床休息，制动，尽量避免着凉或者劳累，劳损等不利因素，局部可以外敷活血化瘀的膏药或者配合针刺，艾灸等物理疗法，以促进囊肿吸收，如果左侧腘窝囊肿较大，可以选择手术治疗，切开后将囊肿摘除。
