卵巢巧克力囊肿，直径达到或超过3厘米者，应接受手术，清除“炸弹”爆炸的危险。此时手术多采取巧克力囊肿剥除术，从而最大限度地保留了正常的卵巢组织，传统剖腹手术或腹腔镜手术都能达到治疗目的。术后还需要服用药物巩固疗效。
巧克力囊肿20厘米是非常大的，对于巧克力囊肿的病患需尽快进行手术治疗，术后要服用一些药物进行抗炎治疗。如果确定是巧克力囊肿，不进行手术还会继续增大的，可以进行手术治疗，治疗后一个月正常转经后就可以进行备孕的。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，可引起进行性痛经和不孕。引起巧克力卵巢囊肿的原因很多，要去当地正规专业医院进行检查确诊后及时治疗。选择合适的治疗方法都是可以的。
巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血，手术治疗是好的治疗方式，药物只是可以抑制，并不能彻底的解决问题，对于巧克力囊肿，如何治疗要听医嘱，要根据个人的身体状况。
是良性的就不用治疗吗，巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种临床表现方式，如果严重了，影响了排卵，或是导致输卵管梗阻就会影响怀孕。可以先到医院妇科进行孕前检查，如果没有大的问题，可以先备孕。临床上，备孕一年不孕的，才需要全面检查。
可以用一些药物进行治疗，出现痛经，考虑跟巧克力囊肿有关系，是在医生指导下用一些药物进行调理，现在还不能确定。建议是在医生指导下进行调理，平时在生活方面也要注意多喝水，多吃青菜，少吃生冷辛辣的食物，注意腹部的保暖，三餐要规律，定期做好复查。
