主要的副作用有恶心、呕吐、头痛、月经不规则等，而这些副作用事实上并不常见，而且停药后就会消失。紧急避孕药对月经的影响主要表现在月经周期的改变，可能提早或者延迟，尤其是多次重复使用者，会导致月经紊乱、出血淋漓不尽。
通常同房没有采取避孕措施，此后服用紧急避孕药，停药后的3天-7天有撤退性出血，没有出血可能是避孕失败，怀孕导致的。紧急避孕药有90%的概率成功避孕，但是有10%的概率避孕失败。若没有出血建议密切观察，月经推迟建议到医院检查人绒毛膜促性腺激素，若人绒毛膜促性腺激素升高，则是怀孕，表明避孕失败。可能是药物疗效不好或女性敏感性不好，服药超过72小时也是能的。
不一定就会导致撤退性出血。没有撤退性出血，并不能够再代表避孕失败。现在自己注意多休息，过一段时间自己用早早孕测试一下，或者去医院抽血化验一下。
紧急避孕药一年内服用不应超过三次，每月一次。如果一周吃两次紧急避孕药，对身体是有害的。一个星期吃了两次紧急避孕药的危害，比如会导致月经紊乱，内分泌紊乱，还会有恶心、呕吐、子宫异常出血、经期改变等。
但一般来说，副作用会随着药物的代谢而逐渐消失。这期间要注意多吃新鲜水果、蔬菜，多喝水，促进身体新陈代谢。
一般情况下，一个星期吃了两次紧急避孕药的危害包括月经失调、药物性肝炎、恶心、呕吐、异常子宫出血等，具体分析如下：
72个小时之内可以口服紧急避孕药，但这种药物中的雌性荷尔蒙含量很高，一年之内最多只能吃三次。一周服用两次，会导致月经失调、药物性肝炎、恶心、呕吐、异常子宫出血等。在日常生活中，不能生育的话，要采取适当的避孕方法，以免对身体造成损害。
服用紧急避孕药后，一周左右出现不规则阴道出血是药物反应的正常现象。如果阴道出血时间不长，属于正常现象，不需要治疗。但如果出血量大，持续时间长，且不断滴漏，那么就要考虑是药物引起的内分泌紊乱了，需要及时到公立医院妇产科就诊，以免阴道出血引起失血性贫血。
需要注意的是，患者在治疗期间，要严格卧床休息，避免下床活动，对身体有较好的治疗效果。
