附睾囊肿无症状者不需治疗，症状较重或囊肿体积较大且已婚有子女者可行手术摘除。手术有可能破坏附睾管而影响生育，故对未婚病人宜慎重。如果确定有附睾炎可以选择输液治疗。
一般情况下，附睾囊肿通常不会导致男性出现阳萎，具体情况分析如下：
附睾囊肿是一种囊性疾病，是一种常见的泌尿系统疾病，常发生于人体的附睾，当其体积很少的情况下并无明显的临床表现，但是当其体积逐渐扩大后，会产生阴囊底部的不适。如有感染会出现发热、红肿等症状。阳萎是一种不能勃起、勃而不坚、坚而不坚硬的疾病，也就是所谓的勃起功能障碍。
附睾囊肿也就是精液囊肿，它的发病原因可能是输精管阻塞而导致精液积聚。多见于附睾头附近，邻近或位于睾丸上极的背面。其大小变异范围很大，有的较小，直径只有几毫米，有的像玻璃球那么大或像睾丸那么大，大者直径可超过10厘米。
附睾炎和附睾囊肿是根本不同的，附睾炎一般会有明显的红肿热痛的炎症症状，附睾囊肿没有明显的不适，如果较大的附睾囊肿会有一定的肿胀或者下沉感。可以做一下阴囊彩超就可以一目了然了。
附睾囊肿是一个生长在睾丸顶端的充满液体的囊。是良性的即非由癌症引起。有些男人只有一个囊肿另一些在两个睾丸上有多个囊肿。很少见的是，可以与引起身体其他部位囊肿的疾病相关联。小囊肿不需要治疗。
精索静脉曲张是很常见的男性疾病，精索静脉曲张会导致精液质量的下降，而对性生活是没有什么影响的。附睾的囊肿一般多考虑是精液囊肿。可以进行手术治疗，药物是没有什么效果，而且要保持良好的生活习惯，避免长时间的站立，并定期复查了解情况。
