果单纯性肾囊肿直径大于六厘米以上，或产生了压迫症状，可以通过肾囊肿去顶减压术来得到治愈，但是不能保证肾囊肿不再复发。然而如果是遗传性肾囊肿，通常表现为多囊肾合并多囊肝，目前来说没有办法治愈，仅在多囊肾囊肿较大时，可以通过去顶减压手术来得到缓解。
艾灸是不能治疗肾囊肿的，药物也不能治疗肾囊肿，肾囊肿的发病的原因是扩张的肾小管，这段扩张的肾小管，逐步独立，就形成一个囊肿，肾小管的壁有分泌功能，分泌液多就会囊肿增大，分泌液少囊肿增大的不明显。
肾囊肿穿刺，如果是个单发的肾囊肿，一般都是门诊手术。穿刺后，一般要求病人24小时平卧休息，但是如果是囊肿是多发的囊肿，这种穿刺一般要求住院治疗，住院穿刺后，一般还要休息三天左右。
肾囊肿是一种良性的。如果体积很小，通常没有明显的不适。建议病人进行肾彩色多普勒超声检查。如果囊肿体积较小，应该进行骨科检查以确定是否是由腰椎间盘突出或腰肌劳损引起的。如果囊肿的体积超过4厘米，可以通过手术切除。开放手术恢复时间约为一个月。
肾囊肿手术就是把肾囊肿的顶去掉，相当于把锅的锅盖揭掉一样，尽量不让里面的囊液对肾脏的实质形成压迫，减少对肾脏的损害。肾囊肿一般有急性感染的全身表现，如高热、寒战等，一侧肾区剧痛，肌肉紧张，脊肋角有明显叩击痛。血白细胞增多，尿中有白细胞，细菌培养阳性。IVU示肾盂肾盏受压或充盈缺损。B超示肾区液性暗区以及可导致肾积脓的原发病变。
