至今还没有用很好的药物治疗瘘。肛门瘘的诊断通常需要手术治疗，只能通过手术。如果从瘘口流出大量分泌物，就可以用中药汤剂苦参汤熏蒸汤或黄柏液，保持局部卫生，如果有感染，就可以结合抗生素治疗。在日常生活中，有必要预防瘘的发生。肛瘘主要是肛门周围脓肿破裂后形成的瘘，肛周脓肿主要由肛腺感染。因此，有必要避免便秘和腹泻，需要少吃辛辣刺激的食品。
微创手术治疗肛瘘的好的方法，HCPT微创治疗HCPT微创治疗，找到所有内口，直接向内口进行微创凝固，使肛瘘内口闭合，冲洗脓在瘘管内使其愈合。整个手术有序，肛瘘在20分钟内缓解。
肛门周围红肿热痛，感觉摔倒，大便出血多，甚至出现脓性表现。肛瘘的诊断已经得到证实。一旦确诊，需要尽快进行外科治疗，单纯药物治疗效果不好。细菌等逆行感染容易导致腹腔和盆腔等感染，严重的病例可能导致菌血症和败血症等风险。抗生素主要用于加强抗炎治疗。
肛瘘只能通过手术治疗，因为保守治疗不能完全治得好。大多数肛瘘需要在腰硬联合麻醉下进行肛瘘切除术或拉丝手术。其中大多数可以在手术后治得好，但不排除复杂性肛瘘的可能性。复杂性肛瘘，很难完全治的好。手术后外阴应该清洗并保持干燥。
肛瘘不会自愈，必须手术进行。如果是复杂性的需要分步解决，一步到位有可能造成“后遗症”，需要再次到正规医院肛肠科做进一步检查和手术处理，平时注意少吃辛辣刺激性的食物，还要注意局部卫生。
