引起病理性睾丸变小的原因很多，最常见的有慢性消耗性疾病、内分泌障碍(甲状腺、脑垂体机能减退)、持续高热、服用大量雌性激素、病毒性睾丸炎(如腮腺炎并发睾丸炎)、睾丸梅毒等。这些病症均可使睾丸萎缩，以致于体积小于正常。病理性的睾丸萎缩变小，通常是因曲细精管的精原细胞或精母细胞容易受累，当这些细胞发生萎缩，不能生长精子，或受到损害不能产生正常的精子时，就表现为睾丸萎缩体积变小。往往伴有不育症。
男性染色体多了一条X染色体，称克氏综合征，又称先天性睾丸发育不全综合征。是一种性染色体异常疾病。可以通过补充雄激素获得正常的第二性征。如果想生育，睾丸附睾显微穿刺取精若能取到精子，可以获得自己的后代。
睾丸发育不良有许多原因。首先，有必要弄清楚是否存在隐睾或光滑的睾丸，因为睾丸温度太高，不会导致生精功能障碍和睾丸发育不良。其次，病毒性睾丸炎、高热引起的睾丸组织水肿以及腮腺炎合并睾丸炎引起的睾丸纤维化需要排除。第三，先天性染色体异常。常见染色体异常引起的睾丸发育不良是Creutzfeldt-Jakob综合征，伴有47号染色体和XXY染色体。
现在已经过了发育的年龄，太小是没有药物可以治疗的，可以去医院做延长手术进行治疗，可延长三厘米左右。平时需要注意适当的增加锻炼，阴茎小有可能是缺乏激素、手淫过度或者个人体质等因素导致的。
睾丸和阴茎小能治疗，如果需要生长，只能去正规的三甲医院做延长手术进行治疗。阴茎的长度和人的身高，胖瘦是一样的，都有个体差异，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才怀疑为阴茎短小的。性生活过中，阴茎的长度大小只是一个方面，其他因素也有很重要的影响，如性爱的技巧，夫妻关系的和睦等。
睾丸发育不良很容易诊断，一般泌尿外科医生，或者是男科医生，比较有经验的，用手去触摸睾丸，就可以分辨出睾丸的大小和质地是不是发育的好，通过体征结合病理诊断，再加上大夫检查，睾丸发育不良症是好确诊的。及早治疗，就会完全治好。
