如果是良性的，手术以后就能治愈，不会影响正常的寿命。如果是恶性的，大多都容易复发，不能切除者生存期大约在9~12个月左右，原发灶切除彻底无转移病灶者最长可存活5年左右。
胃间质瘤，如果是长在胃上的间质瘤，2cm以内的不需要手术，只要密切随访即可，如果在2cm以上，需要积极的手术切除。如果是中高危的，需要进行规范的靶向药物治疗，最大限度的避免肿瘤的复发。所以手术对于胃间质瘤是非常关键的治疗手段。
胃镜下胃间质瘤切除方法有ESD剥离术，隧道法和全层切除法是剥离术主要的方法，隧道法就是在胃黏膜下打隧道，找到病变挖除，然后把隧道口封闭，ESD挖除法指将黏膜表面剖开，把病变直接挖除。
不是癌症，属于恶性肿瘤。确诊为胃间质瘤，一定要到正规的医院去进行手术切除肿瘤，如果不及时进行手术治疗是很有癌变的可能。如果手术治疗的效果不是特别好，可以进行放疗治疗。
胃间质瘤不属于癌症，而属于肉瘤，并且具有潜在恶性。胃间质瘤的恶性程度，需要依据肿瘤的大小和病理组织进行判定。胃间质瘤的恶性程度可以决定其治疗方式，主要以手术和术后辅助治疗为主。
胃间质瘤是发生于胃，起源于间叶组织，是属于非上皮组织而且恶性程度比较低的肿瘤。但胃间质瘤不同于常见的胃癌，胃癌是起源于胃的黏膜层，起源于胃的叫间叶组织肿瘤，跟胃癌来比是胃上常见的肿瘤，若发展成恶性肿瘤就是胃癌。间质瘤跟胃癌相比是起源不一样，还有是间质瘤少见发生率比较罕见，是少见的胃的恶性肿瘤。间质瘤是交界性肿瘤，可分为低度恶性和高度恶性。