腱鞘囊肿多数病例无须特殊处理，主动注意休息，以免局部受创伤，切忌重复推拿按摩。一旦发生腱鞘囊肿时，可以采取保守性的方法来治愈，主要包括手术以及药物治疗等方面。如局部有某种疼痛表现，并压迫血管神经，导致相应病症，或腱鞘囊肿渐大，此种情况需积极处理。
此外，患者日常应该避免摩擦患处，以免导致病症持续加重。
腕部腱鞘囊肿可以在2周内痊愈。在囊肿发生后，可以选择保守治疗。对于生活有很大影响的患者，可以采用臂丛麻醉下的外科手术，在完全暴露后进行全切，同时要注意不要损伤到周围的筋膜和神经。
囊肿摘除后，局部胀痛、麻木会立即得到改善。伤口需要经常换药，大约2个星期以后再进行缝合，这段时间可以进行手指关节的屈伸运动，以防止肌腱的粘连。
腱鞘囊肿手术一般2个星期左右能恢复。
腱鞘囊肿通常出现在手上，在肢体的末梢，例如手腕，手指，脚背，通常需要两个星期的时间，之后三天换一次，两周拆线，拆线之后一星期内要注意不能接触到水和沐浴，这时候可以进行适度的屈伸运动，但要注意不要做过于频繁的屈伸关节，以免出现肌鞘囊肿。恢复期间，患者应避免提拿重物，以免影响手术治疗的效果，导致恢复时间延长。
足背腱鞘囊肿的情况下，保守治疗无效，应及时进行外科治疗。术后要注意伤口的清洁和干燥，同时要注意换药，避免接触到水，以免引起细菌的化脓性感染。通常伤口在两周后就会痊愈。术后要多休息，不要做太多的运动，以免出现腱鞘囊肿复发。足背腱鞘囊肿手术后一般2周左右能恢复。足背腱鞘囊肿手术在术后3天左右，是切口肿胀最明显，1周左右伤口基本逐渐平稳，2周可恢复即可拆线。
一般情况下，脚上腱鞘囊肿手术康复需要根据具体情况判断。
脚上腱鞘囊肿手术只是在皮下进行手术，囊肿切除后对薄弱的关节囊缝合。皮肤愈合2周拆线，关节囊愈合需要1个月，皮肤拆线后会有些局部硬结，一般在2-3个月后逐渐变平变软，一般来说术后2-3个月之后脚就能恢复正常了。
日常生活中，需要注意休息，恢复期间避免剧烈运动，还可以适当食用排骨汤、鲫鱼汤等食物，必要时进行康复训练，有利于促进病情恢复。
可以在门诊手术室就可以进行的。跟一般软组织手术愈合时间一样，一般伤口愈合要两个星期左右，其间一般要注意切口卫生，因为是无菌手术，一般不需要抗生素预防感染，预防肌腱粘连，3到4周一般恢复正常。
