进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
一般查体包括基本检查：身高，体重，血压；内科心肺听诊，外科腹部，乳腺，甲状腺等诊查；骨科，五官科，泌尿科，肛肠科，妇科等专科检查；心电图；影像检查：胸片；超声：肝胆胰脾肾，甲状腺，乳腺，颈部血管等。尿便常规化验，血常规，肝肾功能，血脂血糖的化验，一般男性45岁以上，女性40岁以上查肿瘤标志物。其余检查可根据自身疾病情况及要求增加项目。
检查头部一般是做头部的影像学检查和电生理方面的检查，根据患者的病情不同而选择不同的检查方案。如患者出现头痛，头晕，肢体麻木、无力，可以做头部的CT、磁共振以及脑造影检查。
如果同房导致妊娠，可以在7-10天后用早孕试纸进行检测，也可以到医院采血检测HCG和孕酮，可以初步诊断妊娠。现在怀疑自己怀孕了，可以去药店买一个怀孕测试棒或早孕试纸来测试，以确定怀孕，月经推迟约10天前去医院做B超检查，以确定是否怀孕。
现在的精子检测已经成为了一种常见的方法，在做完精子检测之前要先进行禁欲，一般要求禁欲2-7天内进行，因此禁欲2天可以做精子检查。正常情况下，禁欲2天，患者一次射精次数就会减少，而禁食的次数久了，会导致精子的品质降低，因此要禁欲2-7天进行精子检测。对于精子的检测主要是通过自慰取精，在取完精液之后要及时的做检测，避免引起病菌的感染。成人一次射精2-5ml，精子排出后会变成浓稠的液体，颜色为灰色或乳白色。
