是由于肝内胆管胚胎发育障碍所致，也有一部分是脏器退行性病变所导致的。如果囊肿小于5cm，位于肝脏深部，没有明显的症状，没有出血等问题可以不治疗，定期超声观察就行。如果囊肿大于5cm，位于肝脏表面，有胀痛感等症状，可以考虑超声引导下介入穿刺，抽液。
得了肝囊肿后，在饮食上要注意，以免导致病情加重。首先是不可以吃辛辣刺激的食物，因为这类食物往往会刺激胃肠道黏膜，导致胃酸分泌增多，在一定程度上会加重肝脏的负担的。其次是不能喝酒，酒精会损伤肝脏，并且会加速囊肿的生长，还有可能致癌，所以得了肝囊肿后，一定要戒酒。
体检查出肝囊肿不能喝酒的，酒中含有大量酒精，长期大量饮酒会增加病情的严重性，注意一定要戒酒，防止肝脏功能增加负担，导致病情恶化；注意饮食以清淡为主，避免辛辣刺激、油腻的食物，也不能喝咖啡，保持心情舒畅，定期去医院复查肝功能和B超等，必要时进行肝移植术治疗。
肝囊肿，肾囊肿的治疗需要根据囊肿的大小以及部位，以及临床表现。如果囊肿较小并且没有明显的临床表现可以随访观察，如果囊肿较大有引起压迫症状，需要择期手术治疗，肾囊肿去检查囊肿的大小，对于比较大的囊肿可以进行手术切除，如果是比较小的囊肿或者是对周围组织影响不大的囊肿不需要治疗，但是需要定期去复查。建议要多吃高纤维的食物，不要吃辛辣刺激的食物。在日常生活中要注意休息，避免劳累。
一般比较早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿生长部位不影响患者生活，也可以不做处理。
