不会影响的。巧克力囊肿是卵巢的子宫内膜异位症囊肿。每个月，随着月经来潮出血，子宫内膜出血，在卵巢内部形成巧克力液体，每个月随着月经来潮增大，为了防止破裂必须手术剥离囊肿穿刺。但是手术也不能治疗好。只要月经正常，卵巢功能正常，就会复发。
腹腔镜卵巢囊肿手术至少休息一个月，通常6-8周后可完全恢复正常，但是卵巢囊肿手术后的恢复还要取决于个人的综合体质，多注意休息，饮食要清淡，避免吸烟和饮酒刺激食物，多吃一些蔬菜和水果，恢复期间禁止同房，注意个人清洁卫生，保持愉快的心情。
如果是卵巢囊肿，已经通过手术治疗了。现在伤口已经完全好了。一般在选择正常性生活之前至少要等一个月。因为在这个时候，卵巢剥离伤口已经完全好。自己的身体，也应该回到原来的状态。
打算要孩子，巧克力囊肿手术之后，连续用3到6个月，打针期间是不能怀孕的。克力囊肿是子宫内膜异位引起，严重时可以导致组织器官黏连引起不孕。现在手术后打针考虑是为了减少复发。打针期间有正常的性生活，没有避孕的情况下，是可以有怀孕的几率。打针防止复发的药物没有避孕的作用。只要是有精子和卵子结合，就可以怀孕。
卵巢囊肿手术一般是剔除卵巢囊肿的，卵巢是不会切除的，剔除囊肿对生育是没有影响的了，如果切除了卵巢，那么还有另外一侧的卵巢的了，也是可以怀孕的了，只不过怀孕的几率是正常的一半的了。
腹腔镜手术对卵巢囊肿更好，因为损伤小，恢复快。与普通手术相比，更便宜，但恢复时间更长。卵巢囊肿本身不是大手术，手术后，休息一段时间就可以恢复。而且腹部有胀痛，需要检查盆腔有积水的情况。
