头痛的发病机制复杂，主要是因为颅内外痛敏结构中的痛觉感受器，受到剧烈刺激，痛觉由传导通路传导至大脑皮层所引发的。颅内痛敏结构，包括静脉窦，颅底硬脑膜，迷走神经，脑膜前动脉及中动脉，舌咽神经，三叉神经。
睡觉起来后头疼，可能是没休息好导致的，睡眠一般要保证八个小时，才可以保证正常的精力，太少会引起疲乏无力，精神不振，头疼头晕，也可能是着凉引起的感冒发烧，可以测量一下体温，查血常规。
头痛的原因有很多，主要分为原发性和继发性。原发性主要指偏头痛，紧张型头痛，丛集性头痛。这几种头痛主要和遗传因素，情绪紧张，劳累等有关。另一种头痛主要是继发于其它疾病出现的头痛，包括头外伤，颅内肿瘤，颅内感染，脑血管病，这些都可以引起颅内压增高，从而造成头痛。
最近过度紧张劳累，工作压力大等引起的，可能还有心烦失眠，头晕恶心等，需要保证充足的睡眠和营养，头痛明显，可以服用药物治疗，也可以针灸，理疗治疗。注意休息，不要熬夜，养成良好的生活习惯，不要过度紧张。
偏头痛和一只眼睛流泪被认为是偏头痛的急性发作。一般情况下，如果头痛严重，患者可以使用麦角胺咖啡因和曲坦类药物缓解疼痛。有的患者还可以用纯氧吸入缓解偏头痛的发作，眼泪会随着偏头痛的好转而好转。如有病毒感染引起的神经痛，应给予阿昔洛韦滴眼液，或口服伐昔洛韦进行抗病毒治疗，并使用加巴喷丁和普瑞巴林进行对症治疗。
