因炎症引起的较大的输卵管积水或输卵管卵巢囊肿，可行手术治疗。对于输卵管阻塞造成不孕者，可行输卵管整复手术。具体的治疗需要结合个人的临床症状，以及一些必要的检查，在主治医生的指导下进行。
肾积水20mm很严重，在临床上生理情况下，肾积水不会超于10mm，一旦超于20mm，考虑出现梗阻，如急性肾盂肾炎或者是输尿管肾结石等，需要积极治疗。因为肾盂积水会压迫正常的肾组织，使肾皮质变薄，严重时可以出现肾盂化脓或者是肾功能受损、肾功能衰竭的情况。
肾积水不超过6厘米，对胎儿一般没有什么影响，考虑是胎儿憋尿引起的，没有太大问题，无需太担心。建议定期复查，只要不继续增多就好，瓜熟蒂落，自然生产最好，不能正常生产，一般怀孕39周以后可以选择剖宫产结束妊娠。
肾积水可轻可重，轻度肾积水指肾脏形态大小多无明显异常，肾实质厚度及回声正常，肾集合系统分离2—3cm。中度肾积水指肾体积轻度增大，形态饱满，实质轻度变薄，肾柱显示不清晰，肾盂肾盏均较明显扩张，肾集合系统分离3—4cm。重度肾积水指肾脏体积增大，形态失常，实质显得变薄或不能显示，整个肾区均为液性暗区。
对于输卵管积水的治疗，可进行药物治疗，而药物治疗的种类有很多，女性常常以口服药为主，每位输卵管积水病人的情况不同，选择的药物也是有差异的。临床上主要以手术治疗为主。说到用药那就很广泛了，通常有中药和西药之分。但由于对于严重的输卵管积水用药无法治疗，因此极好采用手术。输卵管积水手术可用输卵管伞端造口术，输卵管造口术适用于输卵管近端通畅，远端有积水、闭锁的病人，为传统的治疗方式。
输卵管积水不严重是可以治好的，具体方法有分离输卵管粘连，排出积水，增加怀孕机会，但可再次粘连、积水，不可进行二次手术；辅助生殖技术：促排卵过程可产生孕激素，使输卵管与子宫接口松弛，积水倒流宫腔，易冲掉种植的胚胎，降低试管婴儿的成功率。