原因尚不明确，环境因素和遗传因素相互作用。胎儿的心脏胚胎发育关键时期是在孕第3～8周，若母亲在此期间发生病毒感染，如巨细胞病毒、单纯疱疹病毒、风疹病毒等，导致胎儿患先心病和其他畸形的危险性增加。可能因素：妊娠糖尿病、接触职业因素、生殖系统感染、接触化学物、住新装修居室、服用药物、呼吸道感染、感冒发热、精神刺激、主被动吸烟、接触农药、接触噪声、孕妇饮酒、病毒感染、营养不良。
因为每个人情况是不一样的，所以具体的寿命也不能够确定，主要看是什么性质的先天性心脏病，以及采用的什么手术的，有些简单的先心病，术后可以完全恢复的且不影响寿命的。
先天性心脏病跟母体的因素、遗传的因素和环境的因素有关。母体的因素主要是母亲在怀孕的早期，尤其是在心脏形成的阶段，受到外界环境的刺激导致出现心脏发育畸形。这些环境的刺激主要包括首先是病毒感染，一般的病毒，比如流行性感冒、普通的病毒感冒、风疹病毒、腮腺炎病毒或者柯萨奇病毒感染，都可以导致心脏发育畸形而出现先天性心脏病。
术后可能会出现一些并发症，也叫做后遗症。常见的后遗症为缺损的残余瘘以及纠正矫形并不完全造成的心衰，甚至会出现在手术过程中，低血压灌注造成脑部的缺血缺氧，从而使病人成为植物人的状态。这些都是手术的后遗症。
比如房间隔缺损、室间隔缺损、动脉导管未闭等，可以采取介入治疗得办法，通常费用在30000元-50000元之间。但是对于法洛氏三联征、法洛氏四联征、大动脉转位等需要行大手术治疗，需要的费用会高一些，越复杂的先天性心脏病花费的费用越多。
患上先天性心脏病的孩子，具体能生存多长的时间是不好确定的，因为这个病的病因主要和疾病的种类，以及病人自身的状态都会有一定的关系，而且有一些先天性心脏病的病人并不是都很严重，如果能够积极的配合手术治疗的化，大多数的宝宝是能够取得良好的预期效果的，更不会影响到正常的生存时间。如果是比较严重的先天性心脏病的病人，并且伴有其他并发症的化，这个时候存活时间可能在3~5年左右。
