治疗灰指甲通常需选用抗真菌药物来进行。因指（趾）甲生长较慢，角质层比较厚，治疗时间会比较长，因此治疗时一定要保持耐心，足疗程规范用药。
若患者指（趾）甲出现不规则变形的表现，一般需在用药前将变形的指（趾）甲修挫掉，再外用抗真菌药物，如亮甲复方聚维酮碘搽剂。亮甲是治疗灰指甲的专用药，所含聚维酮碘、阿司匹林等成分可起到杀灭甲下真菌、抑制真菌再生、消炎止痒、加快药物渗透的作用，患者可按疗程并足量用药，能较显著地改善指甲变形、变色、翘起、糟碎、脱落等症状。不过需注意，如患者有多个指（趾）甲都已出现病变，则可在外用药物的同时，遵医嘱与口服抗真菌药物搭配治疗，如特比萘芬、伊曲康唑等。
由于灰指甲治疗周期较长，故用药方面需注意规范，不建议患者采用民间偏方或土方治疗，可能会加重病情或延长治疗时间，对患者的健康造成损害。
大蒜有消炎，解毒的功效。对灰指甲效果不明显，灰指甲是真菌感染引起的。但是是很难完全治疗，应该是配合用抗真菌类的药物，因药物不易进入甲板且甲板生长缓慢，故治疗较为困难，关键在于坚持用药。
平时白醋加蒜治疗灰指甲等效果不是特别的确切，可以用冰醋酸调理，也可以用口服抗真菌药物等治疗。如果特别严重还是需要及时就医，在医生的指导下治疗。平时需要保持局部的干燥清洁，穿宽松鞋透气鞋，不能吃辛辣刺激的食物。
灰指甲是属于真菌感染之后所引起的病变，在利用大蒜加醋治疗这个方式下，确实可以取得治疗性效果。只是每个患者的病情程度有所不同，在利用大蒜加醋这种偏方治疗的过程中，所取得效果也自然是会因人而异，并不是说治好概率都是一致的。
患有灰指甲要少吃鸭肉。鸭肉肥腻，属于肥甘食物，根据前人经验，患有灰指甲之人，不宜多吃鸭肉。如清代食医王孟英曾在《随息居饮食谱》中说：多食滞气，滑肠，凡为阳虚脾弱，痞胀脚气，皆忌之。《饮食须知》亦云：鸭肉味甘性寒，滑中发冷气，患脚气之人忌食之。
白醋对灰指甲是没有效果的，灰指甲是真菌感染导致的，而白醋对真菌是没有任何作用的，灰指甲要用抗真菌的药物，真菌感染很容易反反复复发作的。平时要注意卫生，多吃水果蔬菜。
