分期为极低危险度或低危险度的胃肠道间质瘤患者，术后复发或转移的风险较低，一般不需要进行术后的。辅助化疗。部分为中危险度或高危险度的患者，需接受术后的辅助化疗，应口服药物2—3年。坚持术后随访，定期复查。
胃肠道间质瘤也有一定的恶性程度，和肿瘤的核分裂相有直接的关系改变，在确诊之后应首选手术治疗，手术之后会有较高复发以及转移的可能。对于不能够手术或者手术之后伴有复发，手术之后分期不是早期的，需要服用靶向药物进行治疗。
病人身体条件允许可以选择化疗，化疗也是为了使用化疗药物杀死癌细胞，副作用也比较明显，会出现呕吐，恶心，厌食，乏力等。可以配合服用能减轻化疗的毒副作用稀有人参皂苷，增强机体免疫力。
疾病在手术之后大多都是需要再配合化疗等其他的方式进行抗癌治疗的，进行化疗治疗的目的是在杀灭可能残存的癌细胞的，所以，既然现在接诊医生也进行后续的化疗治疗，再进行上面的化疗治疗为好了。
会有复发的可能性。主要是看手术后恢复的怎么样。一定要按照医嘱吃药。和术后恢复。胃肠道间质瘤是一类起源于胃肠道间叶组织的肿瘤，有良恶性之分，目前有手术和化学药物疗法。
通常情况下，食管间质瘤患者需要做影像学检查、细针穿刺活检等检查。具体情况分析如下：
影像学检查：食管间质瘤是原发于食管内除平滑肌瘤或神经源性肿瘤之外的另一类间叶源性肿瘤，食管间质瘤患者可以通过做CT检查明确肿瘤的部位、大小及侵犯范围，做MRI检查显示肿瘤内坏死、出血、囊性变及周围脏器。
细针穿刺活检：食管间质瘤患者可以通过做细针穿刺活检判断肿块的良恶性。
