可自我愈合，不需手术。腘窝囊肿可分为先天和后天两种，前者多见于儿童，后者可由滑囊本身的疾病如慢性无菌性炎症等引起，部分是并发于慢性膝关节病变而导致的。老年人发病则多与膝关节病变如骨性关节炎、半月板损伤等有关。
传统的方法是切开，切除腘窝囊肿，这种方法，手术创伤比较大，术后膝关节功能容易受限，关节后方容易粘连，比较好的方法是由关节镜来进行，腘窝囊肿的切除，首先通过关节镜处理关节内的病变。
诊断为左侧腘窝囊肿，以左侧腘窝处肿大，可见包块，膝关节活动不利。就诊二级甲等以上医院，完善相关检查，行手术切除囊肿，术前、术后预防性抗炎，术后定时换药，以防感染，一般术后12天拆线。术后加强左膝关节屈伸活动功能锻炼。
不想手术消除腘窝囊肿就必须多注意休息，热敷烫洗，就能够使关节积液得到充分的吸收，囊肿就会逐渐的变小。但如果囊肿逐渐增大，引起了膝关节的活动功能受限，甚至压迫到了血管神经，还是需要进行手术切除的。
腘窝囊肿属于良性的包块，如果只是单纯的包块，没有压迫血管神经引起肢体麻木，疼痛或者缺血表现，可以观察。但是如果伴随明显的神经血管压迫，需要考虑手术治疗。腘窝囊肿可以通过彩超，磁共振检查判断囊肿的大小和范围。而且需要和其他的包块比如脂肪瘤，血管瘤等鉴别，术后可以常规的病理检查判断包块性质。腘窝囊肿术后也存在复发的可能性。
腘窝囊肿不断增大，从而可以影响到膝关节的伸屈活动，尤其是可以明显的影响到膝关节的屈曲活动。另外，也可以造成对周围重要的血管神经的压迫，从而引起下肢的缺血症状。
