肉芽肿分为全身性以及局部发作性，如果是全身性的肉芽肿通常都是一些全身性的感染导致的，也有部分病人是不明原因，或者是遗传而引起的。这种一般首先给予全身性的抗感染治疗。如果是局部的肉芽肿，最常见的就是局部的伤口里面有异物，常见的就是一些伤口受伤之后的一些泥沙或者其他异物导致在里面出现长期的炎症。
肺部的肉芽肿主要是由于肺部的炎症反应所引起的炎性包块，比较常见的就是结核分枝杆菌感染引起的肺结核。肺结核会严重的侵害肺组织，出现不同程度的受损，表现为各种结节以及淋巴滤泡的增生，有渗出、粘连等改变。肺组织可出现不同程度的纤维化、钙化以及比较大的空洞的形成，甚至导致肺不张、肺气肿的形成，使肺功能急剧下降，甚至会引起呼吸功能的衰竭。
部肉芽肿是良性增生肿物，激光治疗或者手术治疗，当然，面积不大，冷冻治疗也是很好的。肉芽增生通常是伤口愈合过程中，形成纤维疤痕等引起的，肉芽增生伤口愈合所出现的。
肉芽肿是指由生物病原体细菌、梅毒螺旋体、真菌、寄生虫等感染引起的。有的肉芽肿一般是一种系统性自身免疫性血管炎，有体液免疫异常和细胞免疫异常参与，可能是由于遗传或病毒等的感染引起的。可以采用中药药物治疗，活血化瘀、消肿止痛、软坚散结、提毒外出、去腐生肌、清热解毒、清除坏死组织，杀菌消炎。迅速打通瘀阻的腺管、消除炎症、消肿止痛。
蕈样肉芽肿的治疗比较麻烦，需要慢慢的调理急不来的。主要的治疗方法是提高免疫力。蕈样肉芽肿属于皮肤疾病，一般无传染性。需要早期诊断早期治疗。如果治疗不及时的话，容易使病情发展成肿瘤，属于恶性肿瘤的一种，存活率很低，尚无明确的治疗方案。平时需要加强防护，避免风寒暑湿的感染，降低抵抗力。所以，蕈样肉芽肿早期是能治愈的。