直肠癌最有效的检查方法，就是做直肠指诊，用手指头检查患者的直肠，绝大部分可以触摸到，检查直肠的时候，直肠指诊要检查出患者肿瘤的大小、位置、是否溃疡，这样可以判断直肠癌，是早期的或者是晚期的，对下一步的治疗，有一定的指导作用，如果直肠指诊没有摸到肿块，可以做进一步的检查。
肠镜检查不只能检查出直肠癌，整个大肠都可以检查。肠镜检查是检查下消化道疾病的重要检查手段，肠镜检查的部位主要是结肠和直肠。结肠包括乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠、回盲部。
肠镜是用来检查大肠方面的问题的，所以不用肠镜来筛选直肠癌。直肠癌的检查方法主要有直肠指检：直肠指检是检查得了直肠癌的常用手段，做检查时可以明显的触及直肠内的肿块，为直肠癌的判断提供的依据。
直肠癌复查包括血常规和肝肾功能的化验，肿瘤标记物的化验，主要是癌胚抗原的测定和糖类抗原的测定，对于直肠癌出现了肝脏转移的病人还需要进行甲胎蛋白的测定。另外就是腹部的超声，肺组织CT和肝脏的CT，必要时也可以进行盆腔CT扫描，而检查的目的主要是为了早期发现转移的病灶。
做肿瘤标记物检查，有两个肿瘤标记物非常重要，一个是CEA，就是癌胚抗原；还有一个是CA19-9。在前2年里每3个月检查一次，2年之内，如果没有任何复发、转移的征象，可以把检查的频度拉长。
