灰指甲涂药后会出现疼痛症状，可能是由于局部的皮肤受到伤害，或是药物的强烈刺激所致。要结合实际情况进行分析和治疗：
1.立即停止使用治疗灰指甲的药物，以免病情恶化。
2.用生理盐水冲洗伤口，冲洗后要注意是否有红肿、皮肤破损、脓性分泌物等。
3.若无脓液，只是红肿、渗液，可用硼酸液湿敷，再外用莫匹罗星软膏。
4.如果有脓性的分泌物，可以用生理盐水冲洗，然后再用药膏湿敷。
如果按照以上方法，2-3日后仍不见效，请到医院检查对症处理。
灰指甲又称甲真菌病，临床上常分为远端侧位甲下型、浅表型、近端甲下型和全甲毁损型。轻度类型的甲真菌病一般不会引起疼痛。远端侧位甲下型、全甲毁损型甲真菌病如果趾甲嵌顿在皮肤里可以引起疼痛；全甲毁损型趾甲明显的增厚走路摩擦时可能引起疼痛不适；白色念珠菌感染的甲真菌病常常合并甲沟炎，局部可以出现红肿疼痛。因甲真菌病有一定的传染性需及时治疗。
灰指甲的期间不会引发疼痛的现象，所以不用担心出现灰指甲，之后更应该做好治疗措施，不然都有可能对自己的指甲造成危害，有可能危害自己的皮肤，这个季节应该注意选择药物进行调理。
灰指甲在使用外用药物包药后会出现疼痛属于正常现象，等待一段时间后即可缓解。
灰指甲是一种真菌感染引起的指（趾）甲病变，治疗上需要通过能够抗真菌的药物来改善，如果包药后出现了疼痛情况，可能是药物进入了病变部位导致的，通常一段时间后就可以恢复正常。患者也可根据自身情况，选择其他外用药物来治疗，例如亮甲牌复方聚维酮碘搽剂，这是一种治疗灰指甲的专用药物，能够有效消灭致病菌，抑制真菌再生，具有显著的杀菌抗炎功效。
灰指甲手疼需要慢慢缓解。当饮食不规律，或者是过度疲劳熬夜的，会导致身体代谢机能异常。指甲能反映身体代谢功能。灰指甲即是身体在向我们发出警告保证休息充足不要进行剧烈运动不要过度行走穿宽松的鞋子局部消毒消炎治疗就可以了，以后有可能指甲会脱落的。