胸腺肽的副作用是恶心、发热、头晕、胸闷、乏力等，少量的患者会出现嗜睡的症状。胸腺肽作为一种免疫调节剂，主要是通过注射的方式进行。胸腺肽可以提高人体抵抗疾病的能力，因为里面包含一部分激素，可以诱导人体的免疫细胞分化成熟，增强免疫细胞的生成。
胸腺肽主要作用于免疫系统，所以早期可能会有刺激免疫的一些副作用，比如发热，局部的疼痛，红肿。反复注射也有可能会引起过敏。这些副作用发生的可能性比较小，还是一个很安全的药物。
胸腺肽注射液能长期用。可以长期服用，但需要在服用期间定期复查肝肾功能，并且十八岁以下病人慎用。胸腺肽肠溶片属于增强免疫力药物，主要用于慢性乙型肝炎或自身免疫功能低下等疾病的辅助治疗。在大量的临床观察中，发现该药物副作用小，是可以长期服用的。但有部分病人可出现肝肾功能轻度异常的情况，停药后即可恢复。因此需要在服药后一个月检查肝肾功能。
注射用胸腺肽的作用主要是治疗各种原发性或者继发性T细胞缺陷病，比如某些自身免疫性疾病、各种细胞免疫功能低下的疾病以及肿瘤的辅助治疗。它主要包括各型的重症肝炎、慢性活动性肝炎、以及肝硬化的治疗，还可以应用于带状疱疹、生殖器疱疹以及尖锐湿疣等的治疗，对于支气管炎、支气管哮喘、肺结核等也有一定的辅助治疗的作用。
胸腺肽不是激素，胸腺肽其实是一组具有生理活性的多肽，主要是氨基酸链接起来的一种小分子的物质，可以诱导t细胞的成熟，主要是调整机体免疫平衡状态，提高机体抵抗疾病的能力。
